【摘 要】
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研究表明,复杂疾病极少是由单个基因产物的变异所致,其致病机理往往是具有重要功能的基因发生突变,这些变异通过分子调控网络影响机体的生物学功能,进而产生了复杂多样的疾病表现型.本文基于基因表达数据和蛋白质相互作用网络(PPIN)数据识别肺癌(lung carcinoma,LC)及乳腺癌(breast cancer,BC)相关的基因功能模块,旨在探究复杂疾病的发病分子机制.本文首先对疾病的基因表达数据进
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研究表明,复杂疾病极少是由单个基因产物的变异所致,其致病机理往往是具有重要功能的基因发生突变,这些变异通过分子调控网络影响机体的生物学功能,进而产生了复杂多样的疾病表现型.本文基于基因表达数据和蛋白质相互作用网络(PPIN)数据识别肺癌(lung carcinoma,LC)及乳腺癌(breast cancer,BC)相关的基因功能模块,旨在探究复杂疾病的发病分子机制.本文首先对疾病的基因表达数据进行差异表达分析,随后与PPIN数据进行整合,进一步利用Heinz搜索算法识别疾病相关的基因功能模块,并对模块中的基因进行功能(GO)和通路(KEGG)富集分析.由蛋白互作网络分析得到疾病相关的相互作用子网,根据蛋白互作子网络得到影响疾病的枢纽节点(hubs)基因,并由富集分析得到子网中基因所参与的生物学过程及生物学通路,发现对疾病发生和发展起到关键作用候选基因标志物.
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