所谓村民自治,是农村中的公民结合法律规定,针对基层中的事务进行独立处理的能力,是我国特色社会主义农村制度中最为重要的形式,也是我国农村基层进行治理的手段之一。在上述制度中,完全体现出我国农民平等和自愿的原则,实现了所有村务的村民自治。村民自治是我国社会主义自治的形式之一,同时也是对社会管理手段的创新,是对农村治理工作提出的全新思路。自上个世纪八十年代开始,农村就在实施村民自治制度,并在后续的工作中取得了较大的成就。村民自治已经得到了社会上很多相关人员的关注,同时,村党支部和村委会之间的关系更加的清晰,甚至是我国的理论界和学术界学者进行关注的重点。在上述制度下,村党支部、村委会等采用什么样的方式运作,才可保证党支部在农村中的领导地位。在整个工作中,也需要保持村委会在工作中发挥其基本职能,这是在农村工作中需要解决的问题。论文中制定了相应的制度,并且和实际情况结合起来,阐述了农村党支部和村民委员会的来源,对“两委”的关系做了内涵界定,针对现状进行了描述,提出“两委”之间的关系和存在的矛盾,同时对两者之间的矛盾提出了解决方案。最后,对在村民自治制度下,如何改善农村党支部和村民委员会的运作模式,以及在制度创新方面进行了探索,旨在有所推进对村民自治进程中“两委”矛盾冲突问题的研究。