特发性智力低下患者染色体亚端粒区微小结构异常分析

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目的:智力低下(mental retardation, MR)是一类常见的神经发育障碍性疾病,智力低下发病率高,在人群中发生率约3%。染色体亚端粒区微小结构异常是引起特发性智力低下的重要原因,而以往的检测技术存在很大的缺陷。本研究探讨多重连接依赖的探针扩增(multiplex ligation-dependent probe amplification, MLPA)技术在特发性MR患者临床检测中的应用。方法:选取25例已知正常或染色体异常的病例,提取其外周血基因组DNA,应用荷兰MRC-Holland公司的P070型MLPA亚端粒探针试剂盒,样本DNA经变性、杂交、连接、扩增等步骤,其产物通过ABI公司3700型测序仪毛细管电泳技术分离,软件分析,将MLPA检测结果与已知核型对照,确定MLPA技术的可信性。在此基础上,应用MLPA检测118例特发性MR患者,对于MLPA检出染色体异常的病例,通过荧光原位杂交(fluorescence insitu hybridization, FISH)等技术进行验证。结果:通过优化DNA质量,调整DNA的用量、DNA的变性时间、PCR反应的条件、毛细管电泳时间与电压等,应用MLPA技术检测25例标本均得到明确的结果,与其它技术分析分析结果一致。应用MLPA技术检测特发性MR患者,发现6例染色体亚端粒区异常的病例:分别为1p36.3区域缺失、1p部分重复、15q部分缺失、15q部分重复、22q部分缺失、12q部分缺失合并17p部分重复。用FISH技术对这些病例进行验证,得到了一致的结果。结论:MLPA技术为智力低下的病因学分析提供了有价值的诊断手段,为对智力低下患者的遗传咨询及预防复发风险提供了依据。这6例染色体亚端粒区微小异常患者的发现,为我们进一步研究表型与基因型的关系、寻找智力低下疾病基因提供了新材料。
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