TGF-β1介导的lncRNA FDNCR1调控猪前体脂肪细胞分化的分子机制

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脂肪细胞分化和脂质沉积对家畜的肉质具有重要的调控作用。研究表明,多种因子通过调节前体脂肪细胞分化进而影响肉质。已有研究证实TGF-β1可能在EMT中起关键作用。然而,关于TGF-β1对猪脂肪形成的作用知之甚少。LncRNA是调控基因表达的一种非编码RNA,可通过多种作用方式参与生命过程。越来越多的研究表明lncRNA影响脂肪形成,然而TGF-β1介导的lncRNA是否影响脂肪形成仍然是未知的。为了探索TGF-β1在猪脂肪细胞分化中的作用及其调控网络,选择用10 ng/mL TGF-β1处理体外培养的猪前体脂肪细胞,并建立了两个cDNA文库,进行了RNA-seq。选出丰富且差异表达的lncRNA,将其命名为FDNCR1(fat deposition-related long noncoding RNA1),进而通过敲减FDNCR1,探索FDNCR1对脂肪形成的作用,并解析其调控机制。本研究中,取得的主要研究成果如下:1.TGF-β1对猪脂肪形成的作用及差异lncRNA表达谱的构建。10 ng/mL TGF-β1显著性降低aP2、PPARγ和C/EBPα的mRNA水平,油红O实验结果显示脂滴减少,表明TGF-β1抑制猪脂肪形成。通过RNA-seq共获得8158个lncRNA,其中差异表达的lncRNA39个,包括上调28个,下调11个。GO富集分析显示主要与organelle,cell,cell part以及其他GO术语相关。KEGG富集分析显示主要与以下功能有关:氨酰基-tRNA的生物合成;神经营养蛋白的信号通路;异亮氨酸,亮氨酸和缬氨酸的降解及Rap1信号通路。基于以上分析,从测序结果中筛选了差异表达的lncRNA,并构建了lncRNA-miRNA-mRNA表达网络。2.FDNCR1通过调控TGF-β通路影响脂肪形成。选择差异显著表达的FDNCR1进行后续研究。通过基因组比对,显示FDNCR1在猪的16号染色体上。通过FISH确定FDNCR1主要位于细胞质中。敲减FDNCR1后,aP2、C/EBPα和PPARγ的mRNA表达显著增加,甘油三酯水平显著升高。另外,敲减FDNCR1显著增加了PGC1α、NRF1和PPARα的mRNA表达以及ATP的含量,但显著降低了ROS水平。我们预测到FDNCR1与miR-204有结合位点,敲减FDNCR1后,miR-204表达水平显著性升高。转染miR-204 mimics可以显著促进脂肪形成。转染miR-204 mimics可以降低TGFBR1的mRNA表达水平并抑制TGF-β通路。共转染FDNCR1 siRNA和miR-204 inhibitor可以恢复miR-204、TGFBR1的mRNA表达水平并恢复对TGF-β通路的抑制作用。结果显示,FDNCR1通过竞争性结合miR-204调控TGF-β通路影响猪脂肪形成。综上所述,在本研究中,分析了TGF-β1介导的FDNCR1通过竞争性结合miR-204调控TGF-β通路影响脂肪形成。解析了FDNCR1、miR-204对TGFBR1表达的调控机理,阐明了FDNCR1对miR-204调控的ceRNA机制,以及对猪脂肪细胞形成的影响。以期从转录后水平揭示猪前体脂肪细胞分化和脂质沉积的分子机制,为猪肉质性状分子育种提供理论支撑。
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