本研究于2011年6月、8月和10月对松花江哈尔滨段六个采样点(S1-S6,下游至上游对应的样点依次为：大亮子、呼兰河、水泥厂、二水源、金河湾湿地和三家子)的浮游生物(包括浮游植物和浮游动物)进行调查。主要研究结果如下：浮游植物共检测出7门125种及变种；其中硅藻55种,绿藻51种,蓝藻11种,其他8种。不同水文期浮游植物丰度变化明显,10月(枯水期,6951.6×104ind/L)>8月(平水期,3556.8×104ind/L)>6月(丰水期,2059.2×104ind/L).生物量在0.692mg/L-7.644mg/L之间波动,最大值出现于8月S3中；最小值于6月S4中。运用典范对应分析(CCA)及生物多样性指数对浮游植物组成、分布及其与环境因子的关系进行了分析和水质评价。结果表明,枯水期Shannon-weaver指数、Pielou指数和Margalef指数比丰水期和平水期低,水质相对较差,其中S2右,S4右,S6中处于重污染。典范对应分析(CCA)显示,水温和浊度是影响浮游植物分布格局的重要环境因子,化学需氧量和总磷也和浮游植物分布有显著的相关性。浮游动物共鉴定出53种,轮虫在种类组成上占绝对优势,共41种,其次是原生动物9种,桡足类2种,枝角类1种。浮游动物生物量变化范围在0.14-3.6mg/L之间。以8月(夏季)S1右采样点最高,为3.6mg/L；丰度波动于180-12030个/L。检测到最高值在10月(秋季)S3右,为12030个/L。依据污生指数评价标准对松花江水质进行综合评价,结果表明,松花江哈尔滨段各采样点均处于中污染状态,秋季水质最差,S4二水源污生指数较高,相对其他站点水体污染严重。经过典范对应分析(CCA)显示,各环境因子中水温,pH,溶解氧和浊度是影响松花江浮游动物群落分布的主要环境因子。