1979年，冻结了30年之久的两岸经贸关系开始恢复。1979-1987年是两岸经贸发展的起步阶段，这一阶段双边经贸交往以贸易关系为主导，其中又以通过香港的转口贸易为主，并且商品种类比较单一，台商投资祖国大陆则处于试探性阶段。 1988-1991年，贸易与投资成为两岸经贸中的两大支柱。祖国大陆的政策鼓励，以及台当局被动放宽限制，都推动了两岸经贸关系的发展。第一波台商投资大陆热出现，劳力密集型中小企业迅速移往祖国大陆，两岸产业分工呈垂直分工形态。两岸贸易与投资相互促进与推动，促成了两岸经贸的持续成长。 1992-1995年，祖国大陆市场经济体制的确立，推动了两岸经贸的新发展，台商投资大陆成为两岸经贸的主导力量，第二波台商投资热出现，并且在投资的规模、地区、领域与期限方面都出现了新变化，与此同时，资本及技术密集型产业逐渐增多。在投资带动下，两岸贸易稳定增长，两岸贸易依存度继续提高，贸易结构趋向合理。 1996年，台当局的“戒急用忍”一度阻挠了两岸经贸关系的发展，两岸经贸关系从步入调整、深化阶段，并且出现了第三波台商投资大陆热。但此时的台商主力，已经从传统产业转向信息高科技，两岸产业分工也由垂直分工转向水平复合分工。与此同时，两岸间接贸易额连创新高，两岸金融、科技、农业领域的合作取得新进展，“三通”也取得阶段性突破。 加入WTO后，两岸经贸进入一个崭新的时期：一方面，WTO规则将推动两岸经贸合作的进一步深化，另一方面，WTO规则的某些规定，也可能为台当局阻挠两岸经贸提供了新的借口。但总体而言，两岸经贸合作的市场动因在加强，经济全球化和区域化的趋势也越来越明显，新形势下，两岸贸易、投资乃至其他领域的合作都将出现一个巨大的飞跃。