从中药中虚拟筛选和鉴定细菌群体感应抑制剂

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长久以来,使用抗生素是人类对付致病菌感染的有效方法,然而伴随抗生素的广泛使用,越来越多的致病菌对抗生素产生了耐药性,威胁人类的健康。群体感应抑制剂(Quorum Sensing inhibitor,QSI)的发现为对抗耐药性致病菌提供了新的思路与希望。 群体感应(Quorum Sensing,QS)是细菌根据环境中种群密度来调控相关基因表达从而协调细菌行为的机制。许多致病菌如铜绿假单胞菌通过QS系统控制致病因子的表达和生物膜的形成。其中生物膜的形成使得致病菌对抗生素的抗性提高1000倍。因此抑制致病菌的QS系统可以抑制致病菌的致病性和增加耐药致病菌对抗生素的敏感性。 本研究的目的是筛选适合人类使用的QSIs。本研究采用虚拟筛选和生物学验证相结合的方法,从中药活性成分中筛选QSIs。 虚拟筛选使用DOCK5.3.0软件,将TraR蛋白与自建数据库的候选物质进行对接。自建数据库包含51种具有治疗肺炎和支气管炎效果的中药活性成分。虚拟筛选的结果显示十几种中药活性成分可能会有良好的QSI活性。随后的生物学验证证实黄芩素是有效的QSI。 生物学实验证明黄芩素在20μM时能有效抑制铜绿假单胞菌的生物膜形成,而不抑制该菌的生长。此外,黄芩素能增加铜绿假单胞菌对氨苄青霉素的敏感性。黄芩素在40 mM,30分钟内能促进QS受体蛋白TraR的有效降解,这可能是黄芩素抑制QS系统的分子机制。 黄芩素是中药黄芩的主要有效成分。黄芩在中国被广泛用来治疗感染已有数千年历史。研究表明黄芩素对人体是低毒的。因此,黄芩素拥有巨大的潜力成为适合人类使用的有效QSIs。
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