人7型腺病毒下调CXCL1基因转录及其作用机制的研究

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wade68
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据世界卫生组织调查,大约有1/5的人腺病毒感染是由7型腺病毒(AdenovirusType7,Ad7)引起的,7型腺病毒属于BI亚属腺病毒。它感染力和致病性较其它型腺病毒严重,可引起致死性肺炎。青年人腺病毒肺炎的病死率为8%~10%,多由腺病毒7型引起。目前对Ad7研究的甚少,病毒感染致病机理尚未清楚。Ad7所导致的致死性肺炎与肺泡Ⅱ型上皮细胞(A549细胞)的免疫炎性反应可能有某种联系。为此,了解Ad7对肺泡Ⅱ型上皮细胞免疫分子基因转录的影响,这对了解Ad7感染致病机制的研究有一定的帮助。基因芯片技术是一种具有高通量、高效率、低消耗的分子生物学技术,它能够在同一时间内,通过少量标本,实现生物基因信息的大规模检测,通过比较正常和疾病状态下的基因转录及其表达的差异,寻找和发现与该疾病相关的候选基因,有可能揭示疾病发生过程中的多个作用环节,同时也能为疾病的诊断和治疗提供分子生物学方面的证据。为此,本论文以Ad7感染A549细胞24h后,先用基因芯片筛选出病毒感染宿主细胞后与对照组比较差异表达的基因,再从差异表达显著的基因中选出部分基因,用RT-PCR技术对基因芯片结果进行验证。最后发现CXCL1在病毒感染12h、24h后基因转录下调,之后对该基因转录的下调进行作用机制的研究,从而为Ad7感染致病机制提供新的思路和线索。  目的:  通过基因芯片技术和RT-PCR技术,筛选出Ad7感染A549细胞后基因转录差异表达的基因,之后对筛选出来的差异转录基因CXCL1转录的下调进行机制研究,为研究Ad7感染致病的分子机制提供新的思路和线索。  方法:  1、基因芯片初筛通过SuperArray基因芯片技术,使用含260个基因的人抗原呈递细胞基因芯片初步筛选Ad7感染A549细胞24h后与正常A549细胞相比差异表达的基因。方法应用TRIzol法分别提取正常(A组)、病毒感染(B组)总RNA;紫外吸收测定法进行RNA质量检测;rueLabeling-AMPTM线性RNA扩增试剂盒进行cRNA标记与合成;芯片杂交;化学发光检测试剂盒进行化学发光检测;最后是图象采集和数据统计分析。  2、RT验证从芯片实验结果选择转录上调基因CCL11、CCL16、HLA-G;转录下调基因CXCL1、CXCL2、HLA-A,设计好相对应的RT-PCR引物,选择病毒感染细胞4h、12h、24h这三个时间点,另设立对照组。用TRIZOL进行总RNA的提取,通过RT-PCR对基因芯片的结果进行验证,进一步更准确的筛选出Ad7感染A549细胞后差异表达的基因。  3、机制研究  1)机制一—Ad7的E1A基因通过细胞脂质体转染技术将构建好的能在真核细胞高表达EIA的重组pIRES-Neo-Ad7E1A质粒即E1A(+)质粒,对照组EGFP质粒即E1A(-)质粒转染A549细胞48h后于荧光显微镜下观察绿色荧光表达量,之后用TRIZOL进行总RNA的提取,RT-PCR技术检测两组细胞CXCL1 mRNA相对表达情况,观察Ad7-EIA基因对CXCL1基因转录的影响。  2)机制二—核转运因子NF-κB Ad7感染A549细胞4h、24h,设立对照组,用染色质免疫沉淀技术检测细胞NF-κB与CXCL1启动子结合程度。  结果:  1、选取Ad7感染A549细胞24h后与正常A549细胞,进行抗原呈递细胞基因芯片检测。结果发现Ad7感染A549细胞24h后较正常细胞基因转录上调2倍以上的基因有5个,基因转录下调2倍以上的基因有12个。  2、RT-PCR的结果表明是在Ad7感染A549细胞12h、24h后与对照组的A549细胞相比,CXCL1基因转录下调,具有统计学意义  3、机制一—Ad7的E1A基因两质粒转染A549细胞48h后于荧光显微镜下观察绿色荧光蛋白表达量为70%,转然效率已达到了实验要求,即成功的构建了E1A(+)A549细胞和E1A(-)A549细胞。之后的RT-PCR结果表明E1A(+) A549细胞比E1A(-) A549细胞CXCL1基因mRNA水平表达明显下调,具有显著性差异。  4、机制二—NF-κB Ad7感染A549细胞24h后与对照组细胞相比,NF-κB与CXCL1基因启动子结合明显减少,具有显著性差异,而感染4h与对照组相比,没有显著性差异。  实验结论:  本实验揭示出Ad7感染A549细胞12h、24 h后,CXCL1基因转录下调。E1A转染实验显示E1A转染的细胞比E1A未转染的细胞CXCL1基因转录下调;ChIP实验表明病毒感染细胞24h后,NF-κB与CXCL1基因启动子结合显著性减少。
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