RNA病毒复制及逃逸天然免疫的机制研究

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RNA重塑蛋白在参与帮助解开RNA复杂二级结构的过程中起到重要作用。RNA重塑蛋白包括RNA解旋酶及分子伴侣。RNA解旋酶以依赖ATP的方式行使功能,而分子伴侣以不依赖ATP的方式行使功能。在RNA病毒复制过程中会产生双链RNA(dsRNA)结构,此时需要RNA解旋酶或分子伴侣来打开dsRNA以帮助基因组复杂RNA结构解链,从而使复制正常进行。一般对于病毒解旋酶的研究仅局限于正链RNA病毒,而负链RNA病毒研究较少。水疱性口炎病毒(VSV)是一类有囊膜的单股负链RNA病毒,其基因组是不分节段的,大小约为11kb。VSV基因组编码5个蛋白:核蛋白(N),磷蛋白(P),大聚合酶蛋白(L),基质蛋白(M)以及糖蛋白(G)。VSV复制复合体由核蛋白(N)、RNA聚合酶(L)、磷蛋白(P)及病毒RNA组成,行使病毒基因组复制的功能。M蛋白参与病毒粒子的组装。G蛋白以三聚体的形式作为表面糖蛋白包裹在病毒粒子表面。我们利用真核细胞表达系统纯化了VSV G蛋白,发现G蛋白具有NTP酶及解旋酶活性,具有解开dsRNA的能力。进一步研究表明,在没有ATP的条件下G蛋白仍然可以部分的解开dsRNA,因此我们认为G蛋白同时具有解旋酶和RNA分子伴侣的活性。G蛋白的解旋没有方向性,在ATP和Mg2+存在时,可以解开5′→3′或者3′→5′的dsRNA以及dsDNA或DNA-RNA杂合链。另外,在没有ATP的条件下,G蛋白的RNA分子伴侣活性可以打开RNA二级发夹结构且促进RNA互补双链退火,并且随着蛋白浓度的增加,退火的效率更高。另外,我们在体外实验中发现G蛋白能够促进VSV RNA聚合酶(L)的复制能力,表明解旋酶在病毒的复制和生活周期中发挥着重要的作用。在本研究中,我们首次发现了VSV G蛋白具有解旋酶和分子伴侣活性,揭示了解旋酶在负链病毒复制过程中的重要作用。由于VSV被广泛应用于生命科学研究中,系统的研究解旋酶及其对复制的影响,为我们今后更广泛应用VSV于肿瘤治疗、基因表达等方面提供了新的思路。RNAi抗病毒通路是一种广泛存在于真核生物中的天然免疫机制。在RNAi免疫反应过程中,病毒RNA复制所产生的dsRNA会被宿主Dicer蛋白识别并切割成siRNA,并被转移到至RNA诱导沉默复合体(RISC),介导与之同源的病毒RNA的降解,从而达到抗病毒的目的。针对RNAi抗病毒免疫,病毒往往会编码RNAi抑制因子(viral suppressor of RNAi,VSR),拮抗RNAi通路,帮助病毒逃逸宿主RNAi免疫。HCV是一类无囊膜单股正链RNA病毒,其基因组大小为9.5kb。HCV基因组编码3个结构蛋白(Core,E1和E2),6个非结构蛋白(NS2,NS3,NS4A,NS4B,NS5A和NS5B)。Core蛋白是病毒核酸衣壳蛋白;NS3具有蛋白酶、RNA解旋酶和NTPase的功能;NS5A是一个磷酸化酶,参与PKR通路;NS5B是一个RdRp,对于HCV RNA的复制起到主要作用。我们在人293T细胞利用VSR筛选系统,发现HCV NS2具有RNAi抑制活性,是一种新发现的重要VSR。进一步的体外凝胶阻滞实验,我们发现NS2能结合dsRNA/siRNA,NS2可以通过与dsRNA结合来阻止Dicer对其剪切从而抑制RNAi通路。最后,我们利用定点突变的方法,确定了NS2上控制VSR活性的关键位点C184。我们的研究不仅发现了的一种新的HCV VSR,揭示了HCV拮抗RNAi信号通路的新机制,同时也为以NS2为靶标设计新的抗HCV药物及疫苗研发提供了必要的理论基础。
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