根据群体遗传学理论,针对等位基因频率资料的特点,以俭约性原理为基础,结合信息的基本原理,该研究提出了在等位基因频率空间重构系统发育的分支分类新方法.同时为了验证新方法的有效性,应用蒙特卡罗数值技术提出了一套模拟研究方法.新方法的基本特点:1)该方法是针对等位基因频率资料的分支分类方法.从纵向的、动态的观点重构研究类群的系统发育关系,而不同于依据遗传矩阵的数量分类方法;2)新方法是建立在群体遗传学的理论基础之上的分支分类方法.借助信息论及其相近学科的理论,结合等位基因的发生、保存和变化规律,研究系统发育信息在进化中的传递和继承以及等位基因频率的变化规律,为系统发育关系的重构方法的形成提供理论依据;3)该方法在等位基因频率空间重构系统发育,是分支分类方法中的一个创新.反映了现成分类群中等位基因组成和频率分布的历史形成过程;4)阐述了等位基因频率具有质量和数量的双重性.充分利用两方面的信息重构系统发育关系,克服了已有的等位基因频率资料分支分类方法大多抛弃频率信息而仅利用等位基因存在与否信息的缺点;5)以等位基因进化俭约性和反映频率变化的信息量化俭约性作为构树和优树选择的依据,具有较强的进化生物学意义.克服了频率变化俭约性和距离变化俭约性的不足;6)祖先类群的等位基因平均杂合性等于或稍低于现在类群,更符合群体遗传学原理.克服了以距离俭约性为基础在频率空间重构系统发育的的其它类似方法朱足;7)将等位基因作为独立性状,分析其析性,在复杂性增加原理(信息量增加原理)的基础上形成有向树;8)计算较为简便.提出了分支分类新方法计算机程序化的思路并已程序化.该程序具有搜索所有可能系统发育分支树的能力并具从中择优的功能.该文研究了平行进化在分支树上不同发生部位对系统发育关系重构的影响差异,揭示了位置的纵向效应和主干、侧枝差异,进一步揭示了平行进化的作用机理.结果表明:树的主干类群发生平行进化其影响真树求解能力的效应远大于同位置侧枝类群的效应.这是该研究的特色之一.