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流行性感冒病毒属正粘病毒科,流感病毒属,是导致人和多种哺乳类动物以及多种禽类发生上呼吸道感染的主要病原体。根据流感病毒内部核蛋白(NP)和基质蛋白(MP)的差异,流感病毒可分为A型、B型和C型三种生物学类型,即甲型、乙型和丙型流感病毒。其中甲型流感病毒是导致流感大流行的主要病毒型,乙型流感病毒主要引起流感的小规模流行,丙型流感病毒很少引起流感流行,因此目前的流感监测网络主要监测的为甲型和乙型流感病毒的变化;其中,甲型流行性感冒病毒感染区间范围最大,并可通过抗原漂移及抗原转换等多种变异形式逃逸宿主免疫,从而造成流感大规模的暴发流行甚至全球性暴发流行,因此危害程度最大。甲型流感病毒根据其包膜表面两种主要抗原即血凝素(hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(neuraminidase, NA)结构和基因特性的不同又可划分为H1~H16、N1~N9等若干流感亚型。目前造成大规模流行的主要类型为为季节性H1N1、季节性H3N2和新甲型H1N1(甲流)流感亚型,随着近年来检测技术发展和严格监测,诸如 H7N9、H5N3等禽流感病毒感染人病例逐渐增多,禽流感已经成为社会关注的焦点之一。 目的:对2009-2015年间山东省日照区域国家流感监测哨点医院(日照市人民医院)收集的流感样病例(influenza-like illness, ILI)鼻咽拭子标本开展流感病毒的核酸检测和病毒分离,旨在明确日照市流感病毒流行及变异情况。 方法:本研究收集2009年~2015年流感样病例咽拭子标本,采用狗肾细胞系(MDCK)进行流感病毒分离;反转录聚合酶链反应(reverse-transcription polymerase chain reaction, RT-PCR)特异性扩增2014~2015年度流行的甲型H3N2流感病毒分离到的甲型流感病毒H3N2毒株的HA及NA基因组序列,进行序列测定。通过MEGA5.0软件对流感分离毒株基因序列进行分析,观察日照地区甲型流感病毒进化规律及分子变异特点;并对日照地区2014-2015年度流感病毒监测分离到的流感病毒毒株序列、流感样爆发病例分离到的毒株序列以及2013年度H3N2病毒毒株序列进行比对,同时与世界卫生组织(WHO)推荐的2014-2015年度的疫苗毒株进行比对,对流感疫苗在日照地区的应用情况进行分析和评估。 结果:①日照市地区流感病毒的流行毒株大体上为交替流行的状态,流行状态主要表现为一种型别毒株呈绝对优势或者几型流感病毒同时流行,除2014年日照地区流感流行中三种流感病毒(甲型H1N1,甲型H3N2,B型流感病毒)所占比例基本相同外,其余几年均为一型流感病毒呈绝对的优势流行状态。②通过对日照地区流行的甲型H3N2流感病毒HA及NA片段的基因比对分析,发现日照地区的甲型H3N2流感病毒在流行过程中存在着变异的现象,其中通过聚集性病例和普通病例的病毒分离株比对发现,聚集性病例的病毒株与普通病例的病毒株在基因树上有明显的不同,分为不同的分支。 结论:①日照地区流感流行毒株类型与山东省其它地区大体一致,流行时间一般晚于全省进入流感流行季,2014年度较往年提前,因此流感的防控既在参考大流行数据的同时必须结合当地的流行特点,并做好流感因变异引起的异常流行的准备。②同型别的流感病毒在一季的流行过程中存在着进化的现象,即上半年的毒株和下半年分离到的流感毒株在基因进化树上明显的分为两簇,而且在平行的流行季节过程中,流感病毒能够发生部分变异,使得该病毒能够逃避人群中已有的免疫力,因而造成聚集性流感样病例的产生,因此加强流感监测,加强流感病毒变异的检测对预防流感的流行具有重要意义。