【摘 要】
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地方鸡在肉质风味及营养特性方面优于快大型肉鸡,但其具体调控机理尚不清楚。因此本研究选取云南地方鸡中的茶花鸡、大围山微型鸡、武定鸡、盐津乌骨鸡、瓢鸡为研究对象,以科宝肉鸡（Cobb-500）作为对照,基于代谢组学研究地方鸡与科宝肉鸡胸肌中的差异代谢物,通过差异代谢物KEGG通路分析探究调控风味形成的代谢通路,筛选代谢通路中调控差异代谢物的基因,采用q RT-PCR技术分析基因表达量与代谢物含量的关系
【基金项目】
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云南农业大学畜禽健康养殖与品质安全省创新团队（2019HC011）项目； 云岭产业技术领军人才培养（云发改人事[2015]1495 号）项目；
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地方鸡在肉质风味及营养特性方面优于快大型肉鸡,但其具体调控机理尚不清楚。因此本研究选取云南地方鸡中的茶花鸡、大围山微型鸡、武定鸡、盐津乌骨鸡、瓢鸡为研究对象,以科宝肉鸡（Cobb-500）作为对照,基于代谢组学研究地方鸡与科宝肉鸡胸肌中的差异代谢物,通过差异代谢物KEGG通路分析探究调控风味形成的代谢通路,筛选代谢通路中调控差异代谢物的基因,采用q RT-PCR技术分析基因表达量与代谢物含量的关系。研究结果如下:1.基于代谢组学研究,五个地方鸡与科宝肉鸡总共发现357个显著差异代谢物,其中共有差异代谢物为L-谷氨酰胺。大围山微型鸡与科宝肉鸡对比,胸肌中有27个差异代谢物显著上调,有29个差异代谢物显著下调;茶花鸡与科宝肉鸡对比,胸肌中有16个差异代谢物显著上调,有9个差异代谢物显著下调;瓢鸡与科宝肉鸡对比,胸肌中有20个差异代谢物显著上调,73个差异代谢物显著下调;盐津乌骨鸡与科宝肉鸡对比,胸肌中有18个差异代谢物显著上调,72个差异代谢物显著下调;武定鸡与科宝肉鸡对比,胸肌中有19个差异代谢物显著上调,有74个差异代谢物显著下调,这些代谢物主要为氨基酸、脂肪酸、肌苷酸、碳水化合物、核苷酸、多胺类物质、生物活性肽、有机酸、核苷酸、磷酸盐等。2.通过对显著差异代谢物进行KEGG通路富集分析,五个地方鸡与科宝肉鸡共富集到69条差异代通路,其中共有的代谢通路为ABC转运蛋白和组氨酸代谢。大围山微型鸡与科宝肉鸡有17条差异代谢通路;茶花鸡与科宝肉鸡有10条差异代谢通路;瓢鸡与科宝肉鸡有15条差异代谢通路;盐津乌骨鸡与科宝肉鸡有11条差异代谢通路;武定鸡与科宝肉鸡有16条差异代谢通路,这些代谢通路主要参与调控氨基酸代谢、ABC转运蛋白、m TOR信号通路、氧化磷酸化、甘油磷脂代谢、脂肪酸生物合成、维生素B6代谢、柠檬酸循环、核苷酸代谢、碳水化合物代谢、膜转运、信号转导等。3.结合显著差异代谢物含量,从信号通路共筛选出11个上游调控基因（ADSL、AMPD1、ABCB8、PRKAA1、PPAT、ADSL、AMPD1、ABCB8、PFKM、IL4I1、C ARNS1、CNDP1）进行q RT-PCR检测,发现基因表达量在不同鸡种间差异表达,并且与代谢物含量相关性一致。综上所述,基于代谢组学研究,地方鸡与科宝肉鸡胸肌中共筛选到的357个显著差异代谢物,其中L-谷氨酰胺在6种鸡中共有,差异代谢物富集得到69条代谢通路,其中ABC转运蛋白、组氨酸代谢在6种鸡中共有。在风味物质形成过程中,IL4I1、PRKAA1、PFKM、WARS、CNDP1、PPAT、CARNS1基因调控氨基酸代谢,ABCD3、ABCB8基因调控ABC转运蛋白,ADSL、PPAT、AMPD1基因调控m TOR信号通路,ADSL、PPAT基因调控嘌呤代谢,这些基因和代谢通路是导致不同鸡种胸肌风味差异的原因,这些基因和代谢通路在不同鸡种胸肌风味形成过程中起重要调控作用。
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