钝裂银莲花（Anemone obtusiloba）是一种青藏高原东缘高寒草甸中比较常见的毒杂草，花色从白色过渡到黄色，为牲畜不食。本文采用RAPD基因组DNA分子标记技术对甘南州不同花色的11个居群进行遗传多样分析，并将遗传多样性与样地的生态因子进行相关性分析。实验结果表明：　　1.合作、碌曲、玛曲和阿孜4个样地的土壤水分含量有显著性差异（P＜0.05），大小顺序如下：玛曲＞碌曲＞阿孜＞合作；4个样地的土壤皆呈现中性偏酸性，但碌曲样地土壤的pH显著低于其他三个样地（P＜0.05）；土壤速效磷含量极高，之间没有显著性差异；全磷含量极高，玛曲和阿孜样地土壤全磷含量显著高于合作和碌曲的（P＜0.05）；有效氮含量极高，但样地之间存在显著性差异（P＜0.05），大小顺序为：阿孜＞玛曲，碌曲＞合作；4个样地的速效钾含量水平均较高，阿孜、玛曲和碌曲的样地土壤速效钾含量之间有显著性差异(P＜0.05），合作的和碌曲的之间也有显著性差异（P＜0.05），合作的与阿孜、玛曲的之间没有显著性差异，大小顺序如下：阿孜＞玛曲＞碌曲，合作＞碌曲。　　2.采用正交试验和单因素试验相结合的方法确定了RAPD-PCR最优反应体系和扩增程序：总体系20μL，DNA模板30ng，primer0.4mmol/L，Taq DNA聚合酶0.5U，dNTPs0.4mmol/L，10×Buffer2μL，Mg2+2.5mmol/L,ddH2O14μL；预变性96℃5min30sec，变性94℃1min10sec，退火37℃1min40sec延伸72℃1min10sec，续补72℃6min30sec，循环数40。　　3.玛曲黄色（MQY）居群的多态位点百分率最高，相对地，玛曲白色（MQW）居群的最低，各地域白色居群多态位点均低于黄色和浅色居群的。总体多态位点百分率高于各亚居群（MQY除外）。各亚居群Shannon信息指数和 Nei’s指数估计的基因多样性大小顺序和多态位点百分率的顺序基本一致。钝裂银莲花的遗传变异主要发生在种群内，但亚居群间已发生一定的遗传分化。钝裂银莲花11个亚居群可以归为3大支，第一支是合作钝裂银莲花；第二支是碌曲黄、浅和白色居群，玛曲黄色和浅色居群；第三支是阿孜黄、浅色居群和玛曲白色居群。　　4.通过钝裂银莲花居群遗传多样性与生态因子相关性分析发现，海拔越低，土壤营养成分含量越低，钝裂银莲花居群遗传多样性越高；土壤含水量、速效氮（AN）含量在钝裂银莲花的地理分布中可能起着一定的作用。