【摘 要】
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软珊瑚与虫黄藻、细菌、真菌等共生,其较强的伤口自愈修复能力,相关研究具有潜在的生物医学应用价值。本研究以海南岛周围海域软珊瑚优势种花环肉芝软珊瑚（Sarcophyton trocheliophorum）为材料,采用高通量测序技术,比较分析花环肉芝软珊瑚创伤前和创伤后24小时样本转录组,并测定创伤后第1天、3天、7天、15天和30天的氧化还原酶活性,从而初步揭示软珊瑚创伤修复的相关分子机制。主要研究
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软珊瑚与虫黄藻、细菌、真菌等共生,其较强的伤口自愈修复能力,相关研究具有潜在的生物医学应用价值。本研究以海南岛周围海域软珊瑚优势种花环肉芝软珊瑚（Sarcophyton trocheliophorum）为材料,采用高通量测序技术,比较分析花环肉芝软珊瑚创伤前和创伤后24小时样本转录组,并测定创伤后第1天、3天、7天、15天和30天的氧化还原酶活性,从而初步揭示软珊瑚创伤修复的相关分子机制。主要研究结果如下:一、通过转录组测序,6个样本共获得258677462条reads,经过软件组装共获得145175条基因,通过9个数据库比对共获得47614条注释基因。其中37477条基因注释到Nr数据库,35369条基因注释到GO数据库,31786条基因注释到Swissprot数据库中,这些基因序列丰富了海南软珊瑚转录本数据库。二、对创伤组和对照组差异表达基因分析,共151条基因出现显著性差异,其中134条基因表达量上调,17条基因表达量下调。对差异表达基因功能富集分析,氧化-还原过程（GO0055114）,氧化还原酶活性（GO0016491）,光合作用（GO0015979）,光合体系（GO0009521）,光合体系II（GO0009523）及光合电子转移（GO0009767）功能得到富集。三、随机挑选5个差异表达基因,通过荧光定量PCR技术对珊瑚转录组数据验证。结果显示5个基因中3个基因表达量显著上调,2个基因表达量显著下调,与转录组数据一致,说明转录组基因序列信息及表达量分析准确。四、酶活指标显示花环肉芝软珊瑚在人为创伤后出现氧化应激现象,SOD活性在受到创伤24小时后增长约6倍,达到峰值（122.56±29.36）U/mg prot后逐渐下降,直至第7天恢复至创伤前同等水平;CAT活性在受到创伤24小时后增长约4倍,达到峰值（13.40±3.89）U/mg prot后逐渐下降,直至第7天恢复至创伤前同等水平,同时花环肉芝软珊瑚GST活性及LPO含量均在创伤后短时间显著升高。此外,对珊瑚共生藻密度与叶绿素a含量测定发现,在珊瑚受到创伤后的短时间内珊瑚会排出部分虫黄藻应对应激反应,而叶绿素a含量的变化会滞后于共生藻含量的变化。
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