人类疱疹病毒8型ORF75基因亚型与新疆kaposi肉瘤的相关性研究

来源 :新疆医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shicyh
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目的:明确新疆Kaposi肉瘤患者感染人类疱疹病毒8型(HHV-8)ORF75基因亚型的分类,初步探讨其与新疆KS不同临床分型及侵袭性的相关性。方法:使用酚-氯仿-异戊醇方法对新疆维吾尔自治区人民医院皮肤性病科从2000年到2008年收集的25例KS石蜡包埋组织进行HHV-8 DNA抽提;然后使用巢式PCR方法对抽提的DNA进行ORF75基因片段的扩增,扩增产物在1.5%的琼脂糖凝胶上电泳,并在凝胶成像系统下观察电泳结果,从而确定ORF75基因阳性标本;然后对ORF75基因阳性标本的DNA进行双向测序;再采用DNASTAR软件把双向测序结果装配成重叠群;然后使用CLUSTALW软件对该重叠群进行核苷酸序列比对,再采用PHYLIP软件包对比对结果进行系统发生学分析,从而确定HHV-8 ORF75基因的亚型分类;最后运用Fisher确切概率法对结果进行统计学分析。结果:(1)25例新疆Kaposi肉瘤有21例HHV-8感染为阳性,阳性率为84%,其中7例AIDS-KS患者HHV-8感染均为阳性;(2)基于ORF75基因位点进行系统进化树分析发现:21例HHV-8阳性患者中,18例为HHV-8 ORF75 A亚型,3例为C亚型。(3)7例AIDS-KS中,7例为A亚型,0例为C亚型;经典型14例中,11例为A亚型,3例为C亚型。(4)21例HHV-8阳性的KS中有10例标本伴有粘膜损害,其中9例为A亚型,1例为C亚型。(5)新疆HHV-8病毒株ORF75基因核苷酸序列(384bp)间的差异性为0~2.39%,其中,A亚型核苷酸序列差异性为0-1.59%(平均差异性0.79%),C亚型为0-2.39%(平均差异性1.19%),A和C亚型之间核苷酸序列间差异性为1.31%~2.39%(平均差异性1.85%)。(6)不同亚型间Kaposi肉瘤患者有无黏膜损害及临床分型的分布差异均无统计学意义(P>0.05),A和C亚型HHV-8感染的KS患者粘膜损害率分别为50%和33.33 %。(7)新疆经典型KS和AIDS-KS患者感染HHV-8 ORF75基因不同亚型的差异性经分析无统计学意义(P >0.05)。结论:(1)新疆KS患者感染的HHV-8具有一定的特殊性。(2)新疆KS患者感染HHV-8 ORF75基因亚型主要属于A亚型和C亚型。(3)新疆KS患者感染的HHV-8 ORF75基因不同亚型与KS临床类型、黏膜侵袭性无关。
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