酿酒酵母属及相关子囊菌酵母的分子分类学和物种多样性研究

来源 :中国科学院微生物研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:snowmansoft
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该论文以酿酒酵母属(Saccharomyces Meyen ex Reess)及相关子囊菌酵母为研究对象,进行了rDNA序列种内保守性和变异性评估、个体基因组内rDNA序列多态性分析、以及国内代表性地区子囊菌酵母生物多样性调查,并对所发现的4个新种,进行了详细的常规和分子分类学研究.首先挑选充分反映或代表酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae Meyen ex E.C.Hansen)种内遗传多样性的菌株,对其ITS和26S rDNA D1/D2区序列保守性和变异幅度进行了充分评估.结果表明该种内D1/D2序列具有较强的保守性,在所研究的菌株中最大变异幅度不超过1个碱基;ITS序列变异性稍大,最大变异幅度达3个碱基;同时,结合染色体核型和生理生化方面的差异进行了讨论,表明根据单一性状进行分类学鉴定的不可靠性.在Kazachstania Zubkova(原属于广义酿酒酵母)和假丝酵母属(Candida Berkhout)中分别挑选了两株菌:CBS 6904(Kazachstania sp.)和AS 2.2352(Candida sp.)作为研究对象,利用分子克隆的方法证实了酵母菌个体基因组内存在rDNA序列多态性现象.在CBS 6904基因组内,至少存在3种不同的ITS类型,其间序列差异主要发生在ITS1中,碱基差异率可达3﹪.在AS 2.2352基因组内,至少存在4种不同的D1/D2类型,其间在3个位置上存在碱基差异.这种个体基因组内rDNA序列多态性给以序列分析为依据的分类鉴定带来了新的不确定因素.该文还对陕西秦岭和湖北神农架地区的子囊菌酵母多样性分布进行了研究.在秦岭地区分离到子囊菌酵母262株,根据形态学观察和D1/D2区域序列分析,鉴定到包括酿酒酵母属在内的10属31个种,其中新种2个,新纪录种5个.在湖北神农架地区分离到子囊菌酵母258株,用同样方法共鉴定到9属27种,其中新种1个,新纪录种5个.从形态学、生理生化、染色体核型、D1/D2和ITS区域序列等多个分类学角度对广义酿酒酵母的一个新种、假丝酵母属的三个新种进行了系统研究,并分别命名为:Kazachstania aerobia sp.nov.,Candida qinlingensis sp.nov.,Candiad diospyri sp.nov.,Candida asparagi sp.nov..
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