水稻长护颖突变体和条纹叶突变体的基因鉴定与qRT-PCR表达分析

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:secretcode
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
第一部分水稻长护颖突变体的基因克隆与表达分析利用EMS对水稻(Oryza sativaL.)保持系品种宜香1B进行诱变,筛选出三份长护颖突变体Oslg-1, Oslg-2和Oslg-3,通过表型分析、等位性鉴定、基因定位和生物信息学分析,以及qRT-PCR表达分析,获得如下结果:1. Oslg-1突变体小穗在幼穗发育早期与野生型无明显差异,但在成熟期其护颖的远轴表皮细胞凸起且粗糙,形成的结节轴向对齐排列,且毛状物较多,形成垂直相间的横纵沟,表皮细胞结构与外稃的极其相似。2.利用F2分离群体对突变体Oslg-1进行基因定位,遗传分析表明,Oslg-1受一对隐性单基因控制,将OsLG基因定位于第7染色体短臂SSR标记RM5344和RM20934之间,遗传距离分别为1.11 cM和0.82 cM,物理距离为246.3 kb。3.对该区域候选基因测序分析,发现LOC_Os07g04670在编码区第182位碱基发生突变(T→A),导致其编码蛋白第61位氨基酸改变(Leu→His)。等位性分析表明,Oslg-2, Oslg-3与Oslg-1属等位变异,进而对突变体Oslg-2和Oslg-3的OsLG基因进行测序,其突变分别发生在第316位(T→A)和119位(T→C)碱基,导致其编码的蛋白第106位氨基酸(Trp→Arg)和第40位氨基酸(Leu→Pro)发生突变。4.对该基因进行序列比对和同源进化分析,其与南美大颖稻较为相近,支持护颖系小花退化假说,该基因突变导致护颖伸长。5.对该类突变材料的候选基因和另一控制护颖性状的PAP2基因进行实时荧光定量PCR (qRT-PCR)分析,结果表明OsLG基因在水稻的叶片、穗、叶鞘和根中均有表达,且在穗部表达最高,而PAP2基因在除穗部以外的其它部位几乎不表达,表明2个控制护颖性状的基因均具有组织特异性,且PAP2基因的特异性更强。在长护颖突变体中,2个基因表达量均下调,表明其具有协同表达特点。第二部分温敏型突变体stripe 1-2和stripe 1-3中的核糖核苷酸还原酶小亚基负责叶绿素的生物合成本论文还对另两份水稻白条纹叶突变体stripe 1-2 (st1-2)和stripe1-3 (stl-3)进行了研究。stl-2和stl-3是利用甲基磺酸乙酯(ethylmethane sulphonate, EMS)对9311进行诱变而来,并经过连续多代自交,条纹叶突变性状能够稳定遗传。主要研究结果如下:1.stl-2和stl-3突变体在二叶期之前表型均正常,从二叶期开始均出现白色条纹状,到分蘖盛期条纹状明显加深。此外,stl-2随温度升高其条纹叶片叶绿素含量会缓慢升高,但直至成熟仍然呈条纹状;stl-3随温度升高叶绿素含量迅速增加,达到30℃后能够恢复生长出正常的绿叶。在农艺性状方面,包括株高、穗长、穗粒数、有效分蘖数、结实率及千粒重,stl-2和stl-3较之野生型均显著下降,且stl-2的千粒重和结实率极显著低于stl-3。2.光合速率在整个生长阶段,野生型比突变体高,具体顺序排列如下:WY>st1-3>st1-2。在不同的发育阶段,野生型中叶绿素a (Ch1a)含量显著高于突变体,叶绿素b (Ch1b)含量只在抽穗期略高于突变体,在其他阶段无明显差异。3.野生型、stl-2和stl-3的叶片亚显微结构的观察表明,在拔节期,野生型细胞中淀粉粒比突变体中的多,突变体的叶绿体中基粒和类囊体膜的层状结构折叠仍发育良好,与野生型相比没有显著差异;在抽穗期,stl-3叶绿体与野生型相比差异不大,但是stl-2的基质类囊体排列松散;在分蘖期和抽穗期,stl-2和stl-3中的嗜锇颗粒均比野生型显著增多。4.利用SSR标记将突变体st1-2基因定位在第6条染色体短臂的RM3438和RM3431之间,进一步设计Indel标记将该基因精细定位于InDel标记Ch6-819-1和Ch6-825-1之间,物理间距约为64kb。在stl-2定位区间中有四个功能基因,发现RNA小亚基基因(RNRS1:LOC_ Os06g14620)仅包含一个外显子,测序发现其在第511位碱基发生突变(G→T),导致其编码蛋白第171位氨基酸(Val→Phe)改变。突变体stl-3与stl-2等位,但突变位点与stl-2不同,其在第685位碱基发生突变(C→T),致其第229位氨基酸改变(Leu→Phe)。5.蛋白结构预测分析表明,RNRS1由15个α螺旋和loop组成。核糖核苷酸还原酶小亚基中的第171位的Val属于保守位点,且该突变位于α螺旋区域以及铁离子活性区,因此可能导致严重的表型变异。但是第229的Leu位点在酿酒酵母、老鼠、人等生物中均为脯氨酸,水稻中这个基因的序列与约氏疟原虫的位点一致。虽然这些序列存在一些差异,但是其二级结构均一致。stl-3突变位于loop区,Yoo等报道的stl突变位于α螺旋区,但均属非铁离子结合区,或许是导致其对温度敏感程度以及表型有别于stl-2的原因所在。6.利用参与叶绿素生物合成和降解途径的重要基因在不同的生长阶段做qRT-PCR。结果表明,RNRS1突变主要影响叶绿素合成途径的胆色素原合酶,粪卟啉原氧化脱羧酶,叶绿素酸酯a氧化酶,原卟啉原氧化酶,叶绿素合酶及脱镁叶绿酸a加氧酶。其他基因的表达变化无明显差异。表明RNRS1能调控参与光合作用的部分基因。7.stl-2和stl-3在不同生长阶段用不同的温度处理,分别在野生型和突变体中检测发现,在L20 (Light 20℃,14h)/D16 (Dark 16℃,10h), L26/D22和L30/D26条件下,突变体中核糖核苷酸还原酶两个小亚基基因(RNRS)表达量的降低比两个大亚基(RNRL)更严重。但在L30条件下,RNRL和RNRS的表达量均低。
其他文献
<正>原发性食管恶性黑色素瘤(primary malignant melanoma of the esophagus,PMME)是一种较为罕见的食管恶性肿瘤,仅占食管原发性恶性肿瘤的0.1%~0.2%[1]。我院于2011年2月收
<正>近日传来一则喜讯,2014年冬至2015年春遂川新建茶园4万亩任务完成过半,落实开发和实现流转山场面积42200亩,开工整地、开挖条带、种植沟和完成植株27811亩。同时,来自全
期刊
中国市场竞争格局已发生巨大改变。20世纪80年代日本企业一流产品到美国、二流产品到欧洲、三流产品到中国的市场竞争策略,已经不可能再继续下去。以提高产品质量和非价格竞
暖通空调系统作为建筑能耗的重要组成部分,做好暖通空调节能设计、降低暖通空调能耗水平是建筑节能的关键。本文分析了现阶段暖通空调设计在节能减排方面存在的主要问题,并提
<正>福建省闽清县有一千多年的陶瓷制造历史,自古以来就有"陶瓷之都"的美誉。凭借丰富的高岭土资源,闽清陶瓷业成为当地特色和支柱产业,但在激烈的市场竞争中也暴露出一些问
目的探讨宫颈小细胞神经内分泌癌的诊断、治疗及预后情况。方法回顾性分析研究18例宫颈小细胞癌患者临床资料。结果 18例患者至随访终止时间点存活10例,其中复发治疗2例,均为
主要给出 Euler常数的几种不同表示形式及其一个推广 ,并通过例子介绍其在求数列极限、定积分、数项级数求和、函数项级数的收敛域及求无穷函数项级数乘积等方面的应用
目的建立护理学硕士研究生科研能力评价指标体系。方法成立课题研究小组,结合相关文献和访谈法,采用Delphi法,对35名入选专家进行两轮咨询。结果初步构建了6个维度20个条目的
<正>背景一、钢管桩基础概况钢管桩基础具有承载力高、沉降小且均匀、抗震性能好等特点,能够较好地同时承受竖向荷载、水平荷载以及风电机组运行产生的振动或动力作用,可打入
以紫薯粉为主要原料,以卡拉胶、黄原胶和果胶构成复配胶,研究紫薯果冻配方及工艺。利用混料设计确定复配胶的最佳配比,将混料设计与响应曲面优化结合探究紫薯保健果冻的优化