压电生物传感器检测单核苷酸多态性的实验研究和临床应用

来源 :第三军医大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:huishou2088
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
一、研究背景和目的近年来,压电生物传感器检测技术逐渐成为生物分析中的研究热点。它具有实时检测、准确定量、特异性高、无需标记、经济性等优点,被认为是现代临床诊断发展的一个新方向。其原理在于压电晶体表面负载的质量变化可通过自身谐振频率变化反映出来,并通过固定不同识别元件,能够检测DNA、抗原-抗体、酶、细菌等多种物质,在分子识别、临床诊断、分子成膜过程、表面性质、毒理研究等领域中已得到较为广泛的应用。同时压电生物传感器操作简便,环境要求简单,检测设备易于微型化使其具有更大的临床应用价值。SNP (single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性)是指基因组特定位置上由单个核苷酸的变异所引起的一种DNA序列多态性,如果人群中这种变异的频率大于1%,即称为SNP。作为基因变异的主要形式,SNPs在对疾病的起因、风险评估和防治方面有着巨大的潜力。其研究已成为人类后基因组时代的主要内容之一。近年大量研究证实,SNP位点不仅与一些人类疾病直接相关、还可以用来预测个体对药物治疗的应答以及作为易患某种疾病的危险人群的标记,对疾病的风险评估和个性化医疗十分重要。因此,SNP的检测技术对于临床诊断医学具有重要的潜在意义,有望为临床疾病风险评估以及个性化医疗诊断的研究开辟新的切入点和研究焦点。关于SNP的大量研究已经鉴定发现了很多和疾病相关的位点,但由于缺乏简单有效快速低廉的临床检测手段,SNP的研究还停留在实验室阶段,SNP潜在应用价值远远没有得到有效地挖掘。而压电生物传感器具有简单实用快速低廉的特点,如能将其应用于SNP的检测将具有广阔的潜在临床应用前景。但SNP只有一个碱基的差异,SNP的检测需要检测方法能从样本中分辨出只有一个碱基差异的目的序列。靶序列和干扰序列之间仅有一个碱基的差异,质量变化小。这给基于质量效应原理的压电生物检测体系带来挑战,需要传感器具有更高的敏感性和更好的特异性。因为本研究拟首先从多个方面提高压电生物传感器的稳定性,然后通过试验证实生物素-链霉亲和素放大系统可以放大压电生物传感器的信号,提高其检测敏感性。在此基础上,建立高敏感的压电SNP检测方法。同时利用EIS方法对压电SNP检测体系进行评估和验证,并对实验条件进行优化。最后,以慢性乙肝易感相关SNP位点为靶点,初步研究压电SNP检测方法在临床标本检测中的应用情况。二、方法和结果1.利用酶生物信号放大系统建立高敏感的压电传感器SNP检测方法:a.探讨生物素-链霉亲和素放大系统用来放大压电生物传感器的检测信号的可行性研究:分别固定标记生物素和未标记生物素的探针于压电传感器基片上,然后加入结合HRP的链亲和素以及DAB底物,检测分析频率变化。结果发现生物素将HRP-SA结合到基片上后,后者催化DAB形成的不可溶沉淀紧密附着于压电基片表面,引发谐振频率显著改变,最低可检测ssDNA片段10-13mol/l,而对照则无法检测出有意义的频率变化。表明酶生物信号放大系统可以用于压电传感器,对发生在后者之上的生物反应信号进行放大,可以有效提高压电传感器的检测敏感性。b.利用酶生物信号放大系统,结合单碱基延伸技术,建立压电生物传感器的SNP检测体系:分别合成两条寡核苷酸,两者间仅存在一个碱基的不同(A/G);将其加入固定有未标记探针的压电检测池,分别利用Taq、Pfu以及Klenow fragment三种不同的DNA聚合酶将biotin-dUTP延伸结合到探针上;最后加入DAB,检测频率变化。结果表明含A碱基的序列能引起频率的显著变化,约20倍高于含G碱基的序列;单碱基延伸所采用的三种聚合酶中,pfu的特异性和敏感性最好。在模式试验中,本方法最低可检测出的最低阳性靶序列的浓度为2×10-11mol/l。与检测普通杂交信号比较,采用放大系统后,信号检测时间可缩短至20min,且结果稳定性更好。2. EIS系统的构建及其应用:将压电传感单元、三电极系统和电化学工作站共同组成EIS检测系统。设定适合分析压电基片表面金膜的电化学参数,对空白时、探针固定后及杂交后金膜表面进行了交流阻抗谱的检测,根据阻抗值分析金膜表面生物学反应情况。实验发现少部分实验用的压电基片空白表面交流阻抗值异常,可影响实验结果的重复性。探针固定和靶序列杂交的实验条件为:针对实验用的压电基片金膜面积而言,最适探针固定浓度为2μmol/l,最适固定时间为60min,靶序列最适杂交时间为60min。在压电传感器检测SNP的每一步骤中,金膜表面交流阻抗值均有相应变化。3.压电SNP检测方法的临床应用:首先以慢性乙肝持续感染相关SNP位点(ESR1 T392C)为靶点,分析并建立适合该位点的SNP检测探针、引物以及标准检测体系。然后收集的临床标本,提取基因组DNA,并进行特异性的扩增。采用压电SNP检测方法对其进行检测。结果表明该方法可以成功检测出临床来源标本中的ESR1 T392C位点。随后以经典的RFLP方法为参照方法,以RFLP检测的27例纯合子为样本,对比分析发现压电SNP检测方法TT型检出率为94.7%,CC型检出率为87.5%。两种方法经x2检验,p>0.05,表明我们建立的SNP压电检测方法在临床标本的实际检测中与RFLP相比具有较好的一致性。三、结论:1.酶生物放大系统可以显著增加压电传感器检测DNA靶序列时的频率变化,和干扰对照序列相比具有良好的特异性。表明酶生物放大系统有望作为一种特异、有效的放大手段应用于压电生物传感器,在检测微小质量变化样本中发挥重要作用。2. EIS是一种有效的方法,可用来评价压电生物传感器,也可以用来优化其检测条件,其建立的实验条件符合压电检测实际情况,可用于压电生物传感器常规检测的标准步骤和标准体系的建立。3.建立了压电SNP传感器检测慢性乙肝持续感染相关SNP位点(ESR1 T392C)的反应体系,初步研究了其频率变化特点;通过临床标本检测,并和传统方法RFLP对比分析,表明我们建立的SNP压电检测方法适合用于临床标本的实际检测。
其他文献
一、存货可变现净值的计算《企业会计准则第1号——存货》(以下简称“新会计准则”)第十五条规定,资产负债表日,存货应当按照成本与可变现净值孰低计量。可变现净值,是指在日常活
本文通过对建筑内装修中存在的消防安全隐患的列举与分析,提出解决办法,展望建筑内装修消防安全发展前景
2012年8月24日,六部委(发展改革委、卫生部、财政部、人社部、民政部、保监会)联合下发了《关于开展城乡居民大病保险工作的指导意见》,由政府主导,商业保险机构承办的大病保险体系逐步展开。2013年1月,湖北省政府办公厅印发了《省人民政府办公厅关于印发湖北省城乡居民大病保险工作实施方案(试行)的通知》(鄂政办发(2013]6号),将大病保险列为全省十件实事之一进行部署,随后相关部门陆续下发了一系列
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
保持党员的先进性,既要靠思想教育,又要靠制度保证。在新的历史条件下,要使广大的共产党员长期受教育、永葆先进性,必须将先进性教育活动中的一些成功做法、新鲜经验转化为经常之
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
在处处讲究质量的现代社会,人们也越来越关注生活的质量,人们对生活质量的要求,首先是舒适而功能全面的建筑产品,为了满足人们这一要求,土木工程建设项目越来越多、规模越来