随着2009年出台的新医改政策不断深入的推广和执行,我国医药物流行业的经济结构、产业形态和竞争格局正在发生巨大的变化,新医改政策不仅加速了医药资源的重新配置、加速行业洗牌的进程,也使得医药物流企业加快转型、加快集中、加快发展势在必行。要在激烈的市场竞争中抢占一席之地,医药物流企业必须持续获得和保持高绩效,不断改进和完善管理模式,提高运作效率,不遗余力降低运营成本。我国的医药物流企业一直十分关注自身绩效考核,也取得了不错的成绩,但是传统的财务评价手段存在极大的局限性,无法对企业的绩效进行全面科学的评价,而平衡计分卡(BSC)弥补了传统方法偏重财务指标的不足,提出了解决办法。本文在借鉴国内外绩效评价研究的理论成果上,分析了新医改政策对物流配送、纯销和零售三种医药行业业态模式的影响,针对医药物流行业的特征以及绩效评价的现状,通过介绍平衡计分卡的基本内容和核心思想,以平衡计分卡的四个角度：财务角度、客户角度、内部业务角度和创新与学习角度为一级指标建立医药物流企业的绩效评价指标体系,采用层次分析法确定所建立指标体系的各级权重,然后根据专家问卷调查法确定的指标隶属度,运用多级模糊综合评价法得出综合评价结果。为了验证所建医药物流企业绩效评价体系的可行性和科学性,本文将该指标体系运用在我国某大型的医药物流企业上进行实证研究。首先建立其绩效考核指标体系,取其2009年的实际经营数据进行模糊综合评价,并针对综合评价结果进行分析,提出具体的改善意见。全文基于平衡计分卡的四个指标维度,在总结国内外绩效评价理论的基础上构建了医药物流企业的平衡计分卡绩效评价模型,采用模糊综合评价法得出评价结果,并结合具体企业进行了实证研究。旨在帮助企业找出核心竞争优势和需要改进的地方,明确企业未来的发展方向,具有一定的可操作性。