大豆(Glycine max(L.)Merr)是重要的粮油和经济作物。大豆白粉病是大豆真菌性病害之一,大豆白粉病可造成10-40%的产量损失。近年来有逐步扩大和加重的趋势。种植抗病品种是防治大豆白粉病最经济、有效、安全的途径。因此,对大豆种质资源进行抗白粉病鉴定为大豆育种提供抗病种质,同时采用全基因组关联分析方法进行抗病基因定位并对候选基因进行预测分析,可以有效推动大豆抗白粉病育种进程。本研究在温室对331份大豆种质资源人工辅助接种大豆白粉病菌,充分发病后,根据对大豆资源的抗性进行评价,筛选出对大豆白粉病抗性较好的大豆资源,并对农艺性状与病情指数的相关性进行了分析。利用50K芯片对全部供试材料进行基因分型,利用Plink1.90进行连锁不平衡分析;利用基于R的软件包mr MLM3.0进行全基因组关联分析,利用i PAT中的GAPIT模块进行基于单倍型的关联分析,利用Plink进行逻辑回归分析,获得与抗病性显著关联的SNP位点;利用Haploview4.2进行单倍型块分析,确定抗病基因所在的区间,参考大豆基因组数据库预测候选基因。主要研究结果如下:1.331份材料中,高抗资源85份,占25.7%;高感资源83份,占25.1%。不同省份高抗资源的比例为辽宁>吉林>黑龙江。地方品种中高抗资源的比例高于育成品种(系),病情指数与生育日数呈显著负相关。2.结合抗病性和农艺性状分析,评价出具有育种潜力的抗白粉病大豆品种(系)12份,可为东北春大豆抗白粉病育种提供抗源材料。3.对50K SNP芯片对331份大豆材料测得的42080个SNP数据进行质量控制,筛选出30,510高质量的SNP位点可以进行关联分析。以LD系数降低到最大值的一般确定LD衰减距离,所用大豆群体全基因组LD衰退距离约为112 kb左右。4.基于30,510个单核苷酸多态性位点计算出来的Scaled-IBS遗传距离矩阵,按照邻接法进行聚类分析,331份供试材料可分为6个类群;采用Structure2.3.4进行群体群体结构分析,也可将供试材料分为6个类群,二者结果基本吻合。5.基于R的关联分析软件包mr MLM3.0,采用6种多位点混合模型方法对大豆对白粉病抗性性状表型观测值进行基于单标记的关联分析,结果表明,mr MLM和Fastmr MLM两种模型对群体结构控制较好,共检测大豆与白粉病抗性显著性相关的SNP标记14个,其中最显著关联的SNP为点ss715624933,位于大豆基因组的16号染色体上,在该位点上下游各110Kb的范围内共有35个基因。6.共有25,502个SNP位点参与了单倍型构建,组合成3,898个单倍型座位;单倍型多态性信息含量显著高于SNP数据的多态性信息含量;基于单倍型的关联分析结果表明位于16号染色体上的连续4个单倍型座位B3027-B3030与大豆白粉病抗性显著关联,其中最显著关联座位为B3028,次显著关联座位为B3029,其中包括ss715624933位点。7.选择病情指数为0的材料76份,将表型设为1(Control),选择病情指数大于75的材料77份,将表型设为2(Case),利用Plink1.90的逻辑回归模型进行关联分析,结果同样检测到ss715624939和ss715624931仍是与大豆白粉病抗性显著关联的位点。8.在单倍型B3026-B3029约36kb范围内有15个基因,在B3030单倍型块内共有4个基因根据基因注释,推测Glyma.16g210800、Glyma.16g211000和Glyma.16g211400可能为重要的抗病候选基因,均具有LRR结构。