食管鳞癌发生过程中基因表达谱变化初步分析

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目的:1.应用Agilent寡核苷酸芯片技术初步分析食管鳞癌发生过程中基因表达谱变化。2.探讨CTHRC1在人食管鳞癌组织、细胞中的表达及临床意义。3.观察抑制CTHRC1表达对人食管鳞癌Eca-109细胞增殖、侵袭及迁移的影响。方法:1.寡核苷酸芯片扫描食管鳞癌患者癌、癌旁及正常组织,挑选明显差异基因进行实时荧光定量RT-PCR验证。2.免疫组化法检测CTHRC1在食管鳞癌组织中的表达,并探讨其与临床病理特征之间的关系。3.免疫荧光、Western-blot观察CTHRC1在食管癌细胞株Eca-109及TE-13中的表达。4.靶向CTHRC1的3对siRNA转染Eca-109细胞,RT-PCR及Western-blot检测CTHRC1受抑程度,挑选干扰效率最佳的siRNA。5. siRNA转染Eca-109细胞,MTT检测细胞增殖;Transwell侵袭及迁移实验观察转染前后细胞侵袭迁移能力;Western-blot法检测MMP2和MMP9表达变化。结果:1.寡核苷酸芯片:配对组织总RNA质量高,反转录cRNA及荧光标记质量好;食管癌共同上调基因38个,下调基因61个。2.实时荧光定量RT-PCR:芯片检测结果准确,CTHRC1差异最为显著。3.免疫组织化学:CTHRC1在食管癌胞膜及胞浆中均见表达,阳性表达率为56.5%。淋巴结转移组高于未转移组(P﹤0.05),与年龄、性别、肿瘤大小、肿瘤分化程度等无明显相关性(P﹥0.05)。4.细胞免疫荧光、Western-blot:在食管癌细胞株Eca-109及TE13中均见CTHRC1表达。5. siRNA显著抑制Eca-109细胞CTHRC1表达,siRNA1干扰效率最佳。6. CTHRC1基因沉默明显抑制细胞增殖及侵袭转移。结论:1.应用寡核苷酸芯片高通量、高效率分析食管鳞癌发生发展过程中基因表达差异,可以筛选新的治疗靶点。2.食管鳞癌的发生发展是一个涉及多基因、多阶段的复杂过程。3. CTHRC1在人食管鳞癌组织及细胞株Eca-109和TE-13中表达上调,且与淋巴结转移相关。4. RNAi可有效沉默人食管鳞癌Eca-109细胞中CTHRC1表达。5.沉默CTHRC1能够抑制Eca-109细胞增殖及侵袭转移,MMP2和MMP9表达下降。
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