广西狂犬病野毒株L基因3′端的克隆和序列分析

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本研究对来自广西不同地区的21个狂犬病病毒分离株的L基因3′端片段进行RT-PCR扩增、克隆和测序,将所测定的核苷酸序列和推定的氨基酸序列与本实验室的GXN119、国内外公开发表的狂犬病街毒、固定毒株及类狂犬病病毒株的相应部分进行了同源性比较分析。结果表明,所测定的广西狂犬病野毒株属于基因Ⅰ型,可分为3个群即Ⅰ群、Ⅱ群和Ⅲ群。其中GX014、GX260、GX08、GX195、GXHX、GXQZD、GXNND、GXWX、GXLA、GXSL、GX01、GX09、GX091共13株属于Ⅰ群,GX074、GXPX、GXPXD、GXLCC、GXPL、GXBM、GX219、GX304共8株属于Ⅱ群,GXN119属于Ⅲ群。Ⅰ群的13株核苷酸同源性为96.9%-100.0%,氨基酸同源性为98.2%-100.0%;Ⅱ群的8株核苷酸同源性为96.5%-99.7%,氨基酸同源性为97.8%-100.0%。广西22个毒株之间核苷酸和氨基酸的同源性分别为85.6%-100.0%和91.6%-100.0%,与固定毒株核苷酸和氨基酸的同源性分别为79.5%-86.9%和85.8%-96.5%,与类狂犬病病毒核苷酸和氨基酸的同源性分别为65.7%-70.3%和70.4%-76.5%。结果表明,广西22株狂犬病病毒之间亲缘关系很近,与其他狂犬病固定毒株亲缘关系较远,与类狂犬病病毒亲缘关系有明显差异。根据遗传进化分析,对L基因3′端的同源性与N、G的分析结果一致,均可分为三群。
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