随着我国流域水环境的不断恶化，保护流域水环境已经成为关涉国计民生的全局性问题。质量型缺水危机警示我们不仅要关注水资源的利用效率，更要防治流域水环境污染。近年来，我国致力于探索流域水环境保护的模式，但是水环境保护的形势仍不容乐观。究其原因多种多样，既有流域水环境承载压力大，经济发展和技术手段没有达到治理水平，流域水环境保护投入不足、保护手段单一等现实问题，更存在相关的环境法律不健全的制度原因。而其中，财税法律制度规制的缺失就是制约流域水环境保护的重要原因。一方面，财税法律制度规范政府的财政行为，直接对流域水环境保护的资金筹集、使用和管理进行规制。另一方面，财税法作为调控法律制度，对规范、引导人们进行流域水环境保护具有不可低估的作用，能够有效引进市场机制对流域水环境进行保护。因我国流域水环境保护事权不明晰，财权划定不合理，财政转移支付乏力，税费尚未形成足够的激励等财税法律制度软肋，导致政府在流域水环境保护中资金投入不稳定，流域水环境市场对财税调节反应缓慢。笔者认为可以从事权与财权的合理配置，财政转移支付的健全，税费的完善三大方面形成流域水环境保护的财税法合力，为流域水环境保护提供制度激励。除引言外，文章主要分为四个部分：第一部分，流域水环境保护的范围界定。首先，对流域水环境的定义及特征进行说明。其次，分析我国流域水环境保护的现实困境。最后，结合流域水环境的特征及保护的现实困境，主张应将流域水环境的保护纳入到财税法律制度的规制中，并在此基础上，阐释财税法保护流域水环境的实质。第二部分，财税法保护流域水环境的应然分析。首先，以可持续发展理论、公共产品理论、外部性理论和公共财政理论作为财税法解决现实困境的理论基础。其次，阐述财税法对促进流域水环境保护的重要作用，进一步说明财税法对流域水环境保护的重要意义。第三部分，我国流域水环境保护的财税制度评析。重点考察我国流域水环境保护中政府事权与财权的划分，财政转移支付制度、税费制度作用于流域水环境保护的现状，发掘我国财税法促进流域水环境保护的不足。第四部分，完善流域水环境保护财税法律制度的路径。总结国外财税制度对流域水环境保护的有益经验，提出完善我国流域水环境保护财税法律制度的路径，实现促进流域水环境改善，健全财税法律制度的目标。