两种荧光定量PCR法检测乳腺癌组织中miR-21的应用分析

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目的:应用SYBR Green Ⅰ荧光染料法和TaqMan荧光探针法检测乳腺癌组织中miR-21,通过两种方法的比较,选择精确度高,成本相对较低,更加适用于临床的miRNA检测方法。方法:收集2010年度遵医附院普外科收治的14位乳腺癌患者的乳腺癌及癌旁组织作为材料共14组,提取总RNA,设计miR-21特异性引物和U6引物反转录成单链cDNA,再分别用SYBR Green Ⅰ染料和TaqMan荧光探针作为指示剂,实时荧光定量PCR检测miR-21在乳腺癌及癌旁组织中的相对表达水平。应用统计学分析SYBR Green Ⅰ染料法与TaqMan探针法检测结果间的差异,最后用Northern Blot法进行实验验证。结果:提取的总RNA经1%琼脂糖电泳显示明显的28s和18s rRNA两条带,且OD260/OD280的比值都介于1.8-2.0之间,提示所得RNA质量较高;熔解曲线显示U6及miR-21的熔解曲线单一,表明其特异性好。U6及miR-21的扩增曲线符合PCR扩增规律,结果可靠。经统计学分析,SYBR Green Ⅰ染料法检测癌组织与癌旁组中的miR-21,经配对t检验显示组间结果有显著性差异(t=6.704P<0.001);Taqman探针法组间比较,表达有显著性差异(t=7.238P<0.001);两种定量PCR方法检测乳腺组织中miR-21表达,经方差分析两种方法的结果间数据无显著性差异(P>0.05)。Northern Blot实验结果与上述结果接近,证明其结果可靠。结论:1.在扩增产物特异的条件下,应用SYBR Green Ⅰ染料法检测miRNA的灵敏度和特异性与TaqMan探针法相近,结果间无显著性差异。由于SYBR Green Ⅰ染料法是一种简单、有效、实用,应用范围广,成本相对较低,是更加适用于临床的miRNA检测方法。2.miR-21在乳腺癌组织中表达上调,与癌旁组织比较,有显著性差异(P<0.05)。说明miR-21表达上调与乳腺癌有一定的相关性。
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