进入21世纪的知识经济时代,关乎国家创新能力和核心竞争力的研究型大学的建设与发展成为了各国政府和高等教育界关注的一个焦点。科学研究处于研究型大学的中心地位,是发展理论和探索高新科技前沿的重要基地。而我国的大学,尤其是那批近年来被政府给予了极好政策和极大资金支持的建设中的研究型大学,在科研管理中还存在着一些问题。目前,中国社会正处于迅速变动之中,中国研究型大学既要在外部和内部的需求与应对之间错综复杂的矛盾冲突中寻求出路,还要与时俱进,不断适应社会的变动。我国研究型大学科研管理面临着新的挑战。本文对我国研究型大学科研管理评价体系研究的相关理论进行了综述,阐述了国内外研究型大学科研管理的经验与教训,对我国研究型大学科研管理的现状进行了深入的剖析,了解了我国研究型大学科研管理存在的问题,对我国研究型大学科研管理所面临的环境进行了分析,从而建立了科研管理评价模型,构建科研管理评价体系。本文选用层次分析法,在构建了评价模型的基础上进行计算,得出各评价指标的权重。并运用此评价模型对哈尔滨工程大学五各院系进行分析,具有现实的应用性。