目的:近年来随着酪氨酸激酶抑制剂等靶向药物的出现,使得非小细胞肺癌患者的总生存期得到了显著延长。但是肺癌基因突变情况错综复杂,并不是所有检测出具有靶向基因突变的非小细胞肺癌患者都可以服用靶向药物。本研究通过检测非小细胞肺癌患者病灶组织中已知的驱动靶向基因EGFR、KRAS、NRAS、BRAF、PIK3CA、HER2基因突变和ALK、ROS1、RET、MET基因融合的情况,分析其临床病理特征,探讨多基因联合检测在临床上对加快筛选有效治疗目标人群的意义。方法:纳入非小细胞肺癌患者875例,收集患者手术切除后经福尔马林固定石蜡包埋的肿瘤组织。提取肿瘤组织中的DNA,采用突变扩增阻滞系统实时荧光定量逆转录聚合酶链反应检测肿瘤组织中EGFR、KRAS、NRAS、BRAF、HER2、PIK3CA基因突变和ALK、ROS1、RET、MET基因融合状态;分析非小细胞肺癌患者EGFR、KRAS、NRAS、BRAF、HER2、PIK3CA基因突变和ALK、ROS1、RET、MET基因融合状态与临床病理特征之间的关系。结果:（1）本研究共纳入875例非小细胞肺癌患者,其中女性54.3%;年龄<62岁53.9%。肿瘤最大径:≤2cm 69.2%;是否侵及胸膜、小支气管壁、脉管和神经:侵及74.9%。淋巴结转移:未侵及71.7%。病理分型:腺癌825例（94.9%）,鳞癌22例（2.5%）,腺鳞癌14例（1.7%）,其他类型8例（0.9%）。组织学分型:以腺泡为主型55.3%,贴壁型13.7%,微乳头型3.7%,乳头型13.2%,实性型10.3%和粘液腺癌2.8%。病理分期:I+II、III+IV期患者分别为80.7%和19.3%。（2）样本肿瘤组织中总驱动基因突变率为67.1%;EGFR突变率为58.6%,其中各突变位点分布为:21外显子L858R占EGFR突变的突变率为52.2%;19外占EGFR突变的突变率为35.4%;21外显子L861Q突变1.9%,18外显子G719X突变4.3%,20外显子插入突变为2.1%,20外显子S768I突变0.2%。余下为双位点突变共16例（3.1%）;ALK突变率为6.1%;ROS1融合突变率为1.0%;KRAS突变率为6.1%;HER2突变率为1.6%;PIK3CA突变率为0.8%;MET突变率为1.6%;没有患者检测出BRAF、NRAS基因突变和RET基因融合。并检测出一例EGFR基因与PIK3CA共同突变的病例。（3）非小细胞肺癌患者总体靶向基因突变率与性别、肿瘤最大径、病理分型和组织学分型存在统计学意义（P<0.05）;EGFR基因突变阳性率与性别、肿瘤最大径、淋巴结转移情况、病理分期、病理分型、组织学分型存在统计学意义（P<0.05）;KRAS基因突变阳性率与性别存在统计学意义（P<0.05）;ALK基因融合率与年龄、淋巴结转移、病理分期、组织学分型存在统计学意义（P<0.05）;总体基因融合率（ALK、ROS1、RET、MET）与年龄、淋巴结转移、病理分期、组织学分型存在统计学意义（P<0.05）。（4）EGFR双位点突变和其他基因突变（HER2、PIK3CA、MET、BRAF、NRAS）与各项临床病理特征均无统计学差异。结论:（1）非小细胞肺癌患者中EGFR、KRAS、ALK基因存在较高的突变率,KRAS基因在男性患者中突变率较高（2）非小细胞肺癌靶向基因在女性、腺癌和腺鳞癌、组织学分型以腺泡型为主的浸润性腺癌、肿瘤最大径≤2cm的患者中突变率较高;在组织学分型以实性型为主和粘液腺癌的浸润性腺癌的患者中突变率较低。（3）EGFR基因在女性、腺癌和腺鳞癌、组织学分型以腺泡型为主的浸润性腺癌、肿瘤最大径≤2cm、病理分期较低和淋巴结无转移的患者中突变率较高;在组织学分型以实性型为主和粘液腺癌的浸润性腺癌的患者中突变率较低。第21外显子L858R是其最常见的突变形式。第18号外显子G719X突变合并20号外显子S768I突变是最常见的共突变模式。（4）ALK基因融合和融合基因（ALK、ROS1、RET、MET）在较年轻、淋巴结有转移、病理分期较高和组织学分型以粘液腺癌为主的浸润性腺癌的患者中阳性率较高。