多基因甲基化联合检测在云南地区肺癌早期诊断中的应用研究

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xiaokun787
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景与目的:肺癌是复杂性疾病,由遗传和环境因素共同作用所致。DNA甲基化体现了机体内部遗传和外界环境的交互作用,是一种早期事件,先于肺癌表型出现之前,在早期诊断中具有潜在的应用价值。同时,大部分肺癌患者在临床确诊之时已到中晚期,寻找一种有效的生物标志物迫在眉睫。而液体活检技术在肿瘤早期诊断、预后,以及精准医疗中占有越来越重要的地位。另外,云南多个地区(如宣威)是世界著名的肺癌高发区。因此,本文旨在通过对该地区肺癌患者样本进行研究,探讨血浆游离DNA(cell-free DNA,cfDNA)中多基因甲基化联合检测在肺癌早期诊断中的意义,并为云南肺癌发生机理提供参考依据。方法:本文研究对象来源于云南地区,其中,23例样本取自于肺癌患者肿瘤组织,42例样本为肺癌患者血浆,此外,10例健康血浆样本作为对照。对于所有样本,均使用试剂盒提取DNA/cfDNA与重亚硫酸盐处理,之后采用巢式甲基化特异性PCR(nested methylation-specific PCR, nMSP)法进行甲基化检测。首先根据文献报道,在肺癌组织样本中检测了8个基因(p16、DLECI、 CDH1、 DAPK、RUNX3、APC、WIF1及MGMT)的甲基化情况,之后筛选出阳性率较高的基因,用于在血浆cfDNA中进行检测。由于9例患者既包括血浆,也含有组织,也对甲基化情况进行一致性分析。此外,部分血浆样本的甲基化及非甲基化产物,采用亚硫酸氢盐测序法进行验证。最后,分析甲基化与患者临床病理信息之间的关系。结果:在组织样本中,除MGMT以外的其余7个基因,其甲基化阳性率在39%-74%之间,并且联合检测时所有样本至少1个基因发生甲基化的检出率为96%,至少2个基因共同甲基化的检出率为91%。其中,p16、DLEC、CDH1、 DAPK、RUNX3这5个基因的甲基化率较高(≥48%),因而在血浆cfDNA中进行检测。结果发现,cfDNA中5个基因的甲基化率在14%-76%之间,并且联合检测时所有样本至少1个或2个基因发生甲基化的检出率分别为95%和71%。健康对照实验中,这5个基因的甲基化均无检出。此外,9例配对血浆和组织样本中的甲基化情况基本一致。结合临床数据统计分析显示,CDH1基因甲基化与肺癌病理分型、临床分期和远处转移有关,而W1F1基因甲基化与肺癌临床病理分型有关。最后,在组织或血浆DNA甲基化情况中,CDH1、RUNX3和W1F1基因易受患者年龄、性别或吸烟等因素的影响。主要结论:(1)云南地区肺癌发生发展与DNA甲基化密切相关,多个基因的甲基化联合检测比单基因更具优势。(2)肺癌样本血浆cfDNA中p16、DLECI、 CDH1、 DAPK、RUNX3等5个基因的甲基化检出具有较高的敏感性和特异性,其组合可进一步研究,有望开发成为云南肺癌早期诊断的表观遗传生物标志物。(3)CDH1基因的甲基化与肺癌临床多个病理特征相关,在肺癌的预后判断中具有一定的应用价值。
其他文献
<正> 笔者于1984年~1986年冬,运用泄热饮加减,治疗小儿高热62例,疗效较好。1 药物组成连翘15g,生山栀10g,薄荷6g,生石膏15g,川军5g。临床加减视病情及患儿年龄而定。2 治疗结
<正> 采用紫雪丹配合柴胡注射液保留灌肠,广泛应用于急性扁桃腺炎、急性喉炎、急性咽炎、口腔炎、水痘、猩红热、腮腺炎等多种疾病所致的小儿高热痛,收到较好的治疗效果。治
目的用电感耦合等离子体质谱法(ICP-MS),测定不同品种及产地花粉的金属含量,为花粉原料选择及合理使用提供参考。方法以34种松花粉和23种蜂花粉为样本,以铑(Rh)、铼(Re)为内
随着全国1∶5万地质灾害调查的开展,及新规范的出版,调查工作更加标准化。平桂区是2018年广西壮族自治区1∶5万地质灾害详细调查工作下达任务的县(市、区)之一。平桂区地质环
互联网技术快速发展的今天,个人信息的保护方法面临着巨大的挑战,只有设定明确的法律规则,对各方主体进行权利义务的限制,才可能在一定程度上杜绝个人信息被滥用。因此,大数
除了公交车、地铁等公共交通方面的改革以外,停车行业的互联网信息化转型升级,也是治理大中城市交通拥堵的有效途径之一。在国家鼓励“互联网+”以及部分城市出台相关停车政
目的:采用原子吸收分光光度法检测不同产地金银花中的Cu、Mg、Ca、Fe、Mn五种微量元素的含量。方法,用浓硝酸和双氧水作为消解试剂,对比电炉消解和微波消解,并用原子吸收分光光度
本文从中药材标准制修订、标准化示范试点、中药材地理标志保护产品等方面研究了云南道地中药材标准化现状,探究了制约中药材产业发展的标准化因素和存在问题,提出了提升中药