本文从高校组织结构特点和高校内部事务出发,界定了学术权力与行政权力的概念,认为学术权力是学术组织或学术人员运用专门知识对学术活动中的学术事务进行判断和评价并做出决定的资格或优越性能。行政权力是行政组织或行政人员在一定的组织管理系统中按照固定的级别层次和职能划分,对职责范围内的事务性工作进行组织和管理的资格或优越性能。二者的辩证关系体现在:学术权力主导、行政权力辅助,学术权力与行政权力相互制约并相互协调。以此作为理论基础,分析了国内外不同国家高校权力关系模式的特点,指出我国高校行政权力主导模式存在的主要问题:行政权力与党委权力在行使上存在交叉;行政权力泛化、学术权力弱化:权力集中向上、决策民主化程度不够。并分析了问题产生的体制与文化原因。针对问题,从我国现实出发,重新调整我国高校权力配置模式:政治权力、学术权力、行政权力合理分权;管理重心下移,学术权力下放;以委员会制的决策模式整合、协调各种权力关系,实现民主管理。最后基于我国现存模式的种种制度缺陷,指出实现我国高校权力关系调整与变革的途径:落实高校办学自主权,减少国家教育行政干预;健全学术组织机构,提升高校学术权力;建立权力自我约束监督机制,保障权力正确行使;修改现行《高等教育法》中相关条款,完善权力行使的法律依据;尊重学术地位与学术权威,营造良好的学术氛围;强化大学校长在协调学术权力与行政权力方面的作用。