我国家养雉鸡MHC B-F基因Exon 2 SNP检测与表达分析

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我国雉鸡遗传资源丰富,家养雉鸡在长期的自然和人工选择下,逐渐适应环境,具有很强的抗病性。主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)是脊椎动物基因组中最具多态性和基因密集的区域。MHC基因在免疫系统中发挥着重要的作用,能够参与机体内和外抗原的呈递,从而对疾病有抵抗的作用。对家养雉鸡MHC基因SNPs检测和表达分析,可以为解释免疫机制提供理论和研究基础,并为预防和治疗疾病提供新思路,为雉鸡抗病育种提供新途径。  本研究利用PCR扩增和测序技术及实时荧光定量PCR技术对我国家养雉鸡种群(中国环颈雉、白化雉鸡、日本绿雉、申鸿雉鸡和黑化雉鸡)MHC B-F基因Exon 2进行多态性检测和不同发育阶段、不同组织中表达含量测定和分析。得到如下结论:  1、扩增得到雉鸡MHC B-F基因Exon 2基因序列264bp,A+T含量为38.85%,G+C含量为61.15%,G+C含量明显高于A+T含量。在我国家养雉鸡5个种群中共检测到29个多态位点,突变率为0.10985,核苷酸多样度为2.606%;共检测有36个单倍型,单倍型多样性为0.693,MHC B-F基因具有丰富的遗传多样性。中国环颈雉、白化雉鸡、日本绿雉和黑化雉鸡这4个种群间的遗传距离都很近,而新培育出来的品种申鸿雉鸡与中国环颈雉、白化雉鸡、日本绿雉和黑化雉鸡这4个种群间的遗传距离较远,5个雉鸡种群遗传距离在1.1192~1.7087之间。  2、MHC B-F基因在我国5个家养雉鸡种群中的胸肌、腿肌、肝脏、肌胃、腺胃、肠和脾脏组织中均有表达,中国环颈雉、白化雉鸡、申鸿雉鸡和黑化雉鸡肝脏组织表达量最高,日本绿雉腿肌组织表达量最高。中国环颈雉在胸肌、腿肌和腺胃组织中,1月龄表达量最高;在肝脏和脾脏组织中,3月龄表达量最高;在肌胃和肠组织中,4月龄表达量最高。
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