【摘 要】
：
中华相手蟹（Sesarmops sinensis）是一种杂食性底栖蟹类,隶属于甲壳纲、十足目、短尾下目、方蟹总科、相手蟹科。在我国,广泛分布于江浙沪等东南沿海地区的潮间带,生活在复杂的环境中,被用作环境变化和水污染的良好指标。由于近年来的环境退化和疾病的频繁暴发,中华相手蟹所处的生态环境遭到严重破坏,其死亡率不断上升,物种资源急剧下降。为了在保护其所处的生态环境的基础上促进沿海经济发展,为了预防疾
论文部分内容阅读
中华相手蟹（Sesarmops sinensis）是一种杂食性底栖蟹类,隶属于甲壳纲、十足目、短尾下目、方蟹总科、相手蟹科。在我国,广泛分布于江浙沪等东南沿海地区的潮间带,生活在复杂的环境中,被用作环境变化和水污染的良好指标。由于近年来的环境退化和疾病的频繁暴发,中华相手蟹所处的生态环境遭到严重破坏,其死亡率不断上升,物种资源急剧下降。为了在保护其所处的生态环境的基础上促进沿海经济发展,为了预防疾病的发生,对中华相手蟹的免疫基因进行研究就显得非常重要。本研究基于高通量测序技术,对经磷酸缓冲盐溶液（PBS,Phosphate buffer saline）、肽聚糖（PGN,Peptidoglycan）、脂多糖（LPS,Lipopolysaccharides）处理的中华相手蟹肝胰腺组织分别进行转录组测序,对中华相手蟹肝胰腺组织在PGN和LPS感染下的差异表达基因进行分析,展示了中华相手蟹肝胰腺组织中与免疫相关的基因以及与免疫相关的代谢通路。主要得到结果如下:1.在经过PBS和PGN刺激后的中华相手蟹肝胰腺转录组中,两组样品分别获得45,491,736条和58,178,646条原始读长（Raw reads）,44,414,140条和56,834,314条干净读长（Clean reads）,共15.19 Gb。拼接组装后共获得85,556个转录本和39,039个unigene,平均长度分别为1,096 bp和1,105 bp,Q30的值均在91.40%及以上。2.在七大公共数据库中对拼接得到的unigene进行基因功能注释,最终在NR、NT、KEGG、Swiss Prot、Pfam、GO、KOG数据库中分别有12,825（32.85%）、3,729（9.55%）、6,603（16.91%）、9,602（24.59%）、13,661（34.99%）、13,661（34.99%）、5,749（14.72%）个unigene得到注释。在KOG数据库的5,749个unigene中,有42个unigene参与到V分类“防御机制”中。在KEGG数据库中,6,603个unigene分散到245条通路中。3.对标准化后的unigene进行差异表达分析,共有1,300个差异表达基因（Differentially expressed genes,DEGs）被筛选出来,其中466个差异基因上调,834个差异基因为下调基因。筛选13个免疫相关基因进行qRT-PCR分析,以肌动蛋白基因β-actin为内参基因。结果显示,这些基因都有着不同程度的上调,与转录组测序结果一致,表明转录组数据具有可信度和所筛选的基因在中华相手蟹面对外界刺激时参与免疫防御过程。4.在PBS对照组和LPS实验组中,两组样品分别得到原始读长（raw reads）有45,491,736条和55,303,248条,干净读长（clean reads）有44,418,190条和53,694,142条,GC含量分别为49.14%和49.87%。从头拼接组装后,共得到94,485个转录本和42,421个unigene,平均长度分别为1,124bp和1,098bp,总核苷酸数分别为106,225,673和46,577,934。5.在七大公共数据库对所获得的unigene进行功能注释,结果表明分别有13,843（32.63%）、4,189（9.87%）、6,995（16.48%）、10,415（24.55%）、14,765（34.80%）、14,765（34.80%）、6,048（14.25%）个unigene在NR、NT、KEGG、Swiss Prot、Pfam、GO、KOG数据库得到注释。其中,127个unigene被归类为“免疫系统过程”,2,183个unigene被注释为“对刺激的反应”。6,995个unigene被注释到KEGG数据库中的231条已知的代谢通路中,有266个unigene参与到“免疫系统”通路中。6.对unigene进行差异分析,共鉴定出1,950个差异表达基因,其中包括1,144个上调基因,806个显著下调基因。在KEGG富集分析结果中发现“肌动蛋白细胞骨架的调节”是差异表达基因富集最多的通路。以18S基因作为内参基因,从差异表达基因中选取8个免疫相关基因进行qRT-PCR分析,结果显示,这些基因都有着不同程度的上调,与转录组测序结果一致,表明所筛选的这些差异表达基因参与中华相手蟹的免疫防御反应。总之,本研究不仅丰富了中华相手蟹现有的转录组数据,而且还阐明了中华相手蟹应对外界（PGN和LPS）刺激时的免疫相关通路和免疫防御机制,这为接下来对中华相手蟹免疫功能基因进行探究提供了理论依据,有助于我们对甲壳动物的免疫防御机制作更深层次的理解。
其他文献
为了探究最佳的抑菌剂,通过对一些抑菌效果较好的食品级抑菌薄膜做预实验,通过观察这些薄膜在水下的防污效果,选出效果最佳的两种抑菌薄膜,确定主要的抑菌剂成分,分别采用滤纸片法和打孔法研究该抑菌成分对小球藻、金黄色葡萄球菌和大肠杆菌的抑菌效果,并对该抑菌成分的最低抑菌浓度（minimun inhibitory concentration,MIC）进行探讨,并研制出不同浓度梯度的抑菌薄膜,采用摇瓶法研究该
产志贺毒素大肠杆菌（shigatoxin-producing Escherichia coli,STEC）是一类重要的人兽共患的食源性致病菌。一旦感染,其产生的志贺毒素（shiga toxin,Stx）会使患者出现发热、腹泻甚至是溶血性尿毒综合征。目前,全球多个国家和地区都报道过由STEC引起的疫情,发现了 470多种与人类疾病密切相关的STEC血清型,近50%疫情暴发原因是食用了被STEC污染的
肿瘤是当前困扰我国居民身体健康最大的问题之一,化疗是治疗肿瘤的常用手段,其中紫杉醇（paclitaxel,PTX）被广泛应用于肿瘤的化疗治疗中,然而单一使用某种化疗药物易产生耐药性,难以获得理想治疗效果,因此需要将PTX通过靶向递送、联合用药等方式以提高其抗肿瘤作用。本课题设计并制备了一种金属配合物作为载体用于递送PTX,协同增强PTX的抗肿瘤作用。聚乙烯亚胺（polyethylenimine,P
党的十九大报告明确指出,“三农问题”始终是国家最为关切的根本性国计民生大事,是全党工作的重中之重。为支持新疆地区的发展,党中央先后召开三次新疆工作座谈会,在产业经济、扶贫攻坚、对口帮扶等方面对新疆地区进行了大力政策倾斜、资金投入以及项目建设等。按照党中央和自治区党委的战略部署,喀什地区要围绕“稳定第一产业、改造提升第二产业、加快发展第三产业,改造提升传统产业,培育壮大新兴产业”,持续推进产业结构优
2020年是脱贫攻坚战的收关之年,为确保我国所有困难地区和困难人口一起迈入全面小康社会,城市困难职工的帮扶也加入了脱贫攻坚的大局。城市困难职工脱贫工作逐渐形成由政府统筹工会牵头,各界社会力量持续发力的帮扶模式,并取得有效成果。本文针对新疆城市困难职工对帮扶工作的满意度设计了调查问卷,采用简单随机抽样法对克拉玛依市、阿勒泰地区以及塔城地区三个地州进行实地调研,共计走访18个市、县（区）涵盖52个乡镇
虫草是一大类具有重要食用、药用和保健功能的真菌资源,它们在医药、食品工业、农业和现代生物技术等多种领域中具有重要的应用价值。由于野生虫草资源稀少,市场需求量大,加之近年来城镇化、工业化进度的加快,虫草生长的自然环境的退化和破坏,虫草资源被滥采滥挖,野生虫草的产量逐年降低,远不能满足市场的需求。因此,急需对虫草进行人工驯化和栽培,对其相关栽培生产技术进行研究和探索,提高虫草的产量和品质,或开发出可人
明胶是从动物的皮肤、骨骼和结缔组织中提取的一种天然高分子材料,广泛用于食品、医药、摄影和化妆品等行业。目前,全球商业明胶主要来源于哺乳动物。由于“疯牛病”、“口蹄疫”及宗教因素的影响,哺乳动物明胶的应用越来越受到限制。来自水产动物的鱼明胶被认为是哺乳动物的良好替代品。此外,水产动物在加工过程中会产生大量副产物,将其制备成明胶,可以有效地提高鱼类加工副产物的利用率。明胶分子结构中具有疏水和亲水区域,
气凝胶是一种低密度的固态物质,亦是世界上已知密度最小的固体。目前,气凝胶的相关研究以无机材料为主,例如二氧化硅、金属氧化物,广泛地应用于隔音、隔热、催化、吸附等领域。近年来,蛋白/多糖类气凝胶凭借其良好的生物相容性和可降解性的优势得到了越来越受到学者的关注。但目前对于此类气凝胶国内外的研究相对较少,工艺配方优化不足,且此类气凝胶的吸湿问题没有完全得到解决。本论文在课题组前期实验基础上,以乳清分离蛋
随着新一轮的课程改革,各个学科的教学效率都得到了极大的提升。而在小学语文课程中,要想真正地提升语文学习效果,就必须从学生的发展和成长角度来考虑,让作业设计真正符合学生的需求,才能真正减轻他们的心理压力,让他们更好地进行学习,促进他们的综合发展。本文基于"双减"背景,对小学语文作业设计展开探讨,以期实现作业设计减负增效。
据连年来北极科考数据显示,随着海冰融化速度明显加快,夏季无冰期即将实现。据统计数据显示,在北极航线的三条航线中,目前已经有国家实现东北航道的全线商业航行。北极航线开通后,成为更具经济性、更具挑战性的海上运输通道,使得世界的贸易市场紧密联通。我国受地理位置和环境的影响,海上运输是我国国际贸易运输的主要途径,而且海上运输具有低价格、高运输量的特点。北极航线开通所引起的海上运输路径的变化终将改变世界贸易