microRNA生物标志物的数据库构建及生物信息学分析

被引量 : 0次 | 上传用户:jxj860205
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
micro RNA是一类小的非编码RNA分子,广泛存在于真核生物中。由于它们在正常发育和疾病病变过程中,作为基因表达的调控者,因此成为了生物医学领域的研究热点。许多研究已经报道micro RNA可作为候选的生物标志物,被应用于疾病或者癌症的诊断、预后和疗效等方面。本论文的研究内容可分了两个部分。第一部分,我们开发了一个高质量的网络数据库用于存储实验验证过的micro RNA与癌症之间的相互关系,从而帮助癌症研究者获取更多micro RNA标志物信息。mi R-abc,一个人工精选的数据库,旨在提供micro RNA作为人类癌症生物标志物的全面信息。目前,mi R-abc包含了228个micro RNA与25种癌症之间的568个关系对。这些数据是通过对Pub Med中的2174篇文献进行处理,从其中的430篇文献中提取挖掘出来的。mi R-abc的网址为http://sysbio.suda.edu.cn/mi R-abc/。第二部分,基于生物信息学模型,我们分析了人类micro RNA-m RNA调控网络,识别可用于脓毒症早期诊断的micro RNA生物标志物。通过分析micro RNA表达数据和micro RNA-m RNA的调控网络,我们获得了脓毒症候选的micro RNA生物标志物。我们利用通路分析,本体论富集分析,蛋白互作网络分析和ROC曲线分析验证这些micro RNA作为生物标志物的可靠性。最终,我们识别了8个新的脓毒症诊断生物标志物。
其他文献
随着我国医疗卫生事业的不断发展,我国社会医疗保险的覆盖率也一直在稳步提升,目前已基本形成覆盖全民的社会医疗保险体系。但是,在社会人员地域流动性不断加快的今天,社会医
剃齿加工是齿轮精加工的一种工艺方法,而径向剃齿法是剃齿工艺中一种更加高效的齿轮精加工工艺。在汽车变速器齿轮的大批量生产中,剃齿是被广泛采用的齿轮精加工手段,按其加
在不同领域的道德判断中,情绪可能起着"催化剂"的作用。一种特定情绪对应一种核心评价;一种情绪只影响某一道德领域的判断,不同情绪的影响是特异性的;进化心理学和具身认知对
<正> 一余华无疑属于一个带有现代派倾向的作家,但是这并不妨碍他按自已的理解对反映生活的追求。有人认为,余华的小说是一种以语言构成的自足体,语言似乎不是为了传达,只是
随着铁路第六次提速,铁道客车转向架疲劳断裂问题越来越显得突出。本文是基于现行的转向架制造工艺提出MAG焊后增加一道TIG重熔工艺,研究新工艺对T型接头疲劳强度的改善作用
<正>现代社会,学校教育、家庭教育和社会教育都是构成现代国民教育体系的重要组成部分。在学校教育、社会教育和家庭教育三种教育的基本形式中,家庭教育
随着社会改革的深化和市场经济的深入发展,我国中小民营企业的发展也成为全国关注的重点之一。民营企业所创造的财富和价值是组成我国GDP的重要成分,也是关系人们生活质量水
文章分析桂林市旅游交通现状与具体存在的问题,提出构建桂林市旅游交通系统,旨在促进桂林市旅游业的可持续发展。
在因美国次贷危机引起世界金融动荡进而引起全球经济增长缓慢的环境下,国内外投资环境恶化,作为关系着国计民生的社保基金,如何降低其投资风险成为社会各界对社保基金热切关
天人关系是中国传统文化的重要命题,自先秦两汉始各家各派就围绕此命题各抒己见。厘清天人相分与天人合一相互关系及其衍变轨迹,及其对教育的影响,从而更清楚我国教育哲学的