采用多维色谱-串联质谱联用技术分析鉴定小鼠肝脏质膜蛋白质。以强阳离子交换柱(5mm×320μm)为第一相，反相柱(150mm×75μm)为第二相，在两相之间通过六通阀连接一预柱(5mm×300μm)用来脱盐和浓缩肽段。用密度梯度超速离心方法获得的小鼠肝脏细胞质膜样品经酶解并适当酸化后通过离子交换柱吸附，然后分别用10个不同的盐浓度进行洗脱。洗脱物经预柱脱盐和浓缩后进入毛细管反相柱进行反相分离，分离后的肽段直接进入质谱仪离子源进行一级和二级质谱的分析。质谱仪采得的数据经计算机处理后用Mascot软件进行库搜寻鉴定。通过这种方法，从小鼠肝组织质膜蛋白提取物中一共鉴定出126种蛋白质，其中43种为膜蛋白或与膜相关的蛋白质，包括用2DE方法所未曾鉴定的具有多跨膜区的部分膜蛋白质。本研究为建立质膜蛋白质组学研究的多维色谱-质谱联用技术提供了有价值的基础性研究资料。 我们还首次对大鼠海马组织质膜蛋白质组进行了研究。通过密度梯度超速离心的方法获得质膜蛋白质后，采取一维聚丙烯酰胺凝胶电泳(1DE)和二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(2DE)结合串联质谱的方法对其进行了分离和鉴定，并对两种不同方法鉴定膜蛋白质的效果进行了比较。发现1DE对膜蛋白质鉴定的效果要比2DE好。在本研究中，通过1DE结合串联质谱的方法一共鉴定出51种基因表达的不同蛋白质，其中有19种位于质膜上。而通过2DE结合质谱的方法只鉴定出19种蛋白质，只有1种蛋白质明确位于质膜上。