随着我国农村信用社体制的不断深化改革,农村商业银行作为一种具有股份制、地方性特征的金融机构初步建立起来,并伴随我国农业经济的发展以及农村人民经济生活水平的提高,逐渐成为我国农村地区极为重要的金融机构之一,极大地推动了我国农村经济的发展。本文选取2005年——2015年安徽肥东农村商业银行的数据进行分析。首先从财务指标上分析影响肥东农村商业银行经营绩效的因素。实证结果表明:第一,收入利润率,非利息收入占比和安徽省GDP及营业外支出占比对肥东农商行的绩效有正向的影响,其中,营业外支出占比正向影响反映了肥东农商行在短时间内两次转型、股权过于分散以及具有非银行背景的股东所带来的代理成本的增加;第二,成本收入比,资产规模和不良贷款率与肥东农商行的经营绩效呈显著负相关,肥东农商行的资产规模的增量高于净利润的增量,以至于二者的比值没有显著增加;第三,肥东农商行净利润的增长与上述部分财务指标显著相关。其次,本文从肥东农村商业银行的内外部两个方面分析影响其经营绩效的因素。综合内外部影响因素发现肥东农商行在股权分布,人才储备,风险管理,业务发展及地域限制等方面具有相应的不足。最后,本文在上述分析基础之上提出完善内部机制,吸引人才,增强服务和风险意识,适当增加股权集中度和引进具有金融背景的股东及派驻董事等相关建议,以促进安徽肥东农村商业银行更好的发展。