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目的:通过基因芯片筛选出甲状腺乳头状癌和相应癌旁组织中的差异基因,再利用生物信息学方法对差异倍数最大基因在甲状腺乳头状癌中的表达情况进行分析,最后用免疫组化的方法进一步验证其在甲状腺乳头状癌和相应癌旁组织中的表达情况,初步阐明甲状腺乳头状癌的发病机制,探索出与甲状腺乳头状癌发生相关的基因,为改善甲状腺癌的治疗效果和预后评估提供理论依据和参考。方法:收集2016年9月~2018年9月就诊于湖南省人民医院乳甲外科,并确诊为甲状腺乳头状癌,有完整资料的患者43位,在其中随机选取3例标本进行早期预处理后获取基因芯片数据,用R软件对基因芯片数据进行进一步分析,从中筛选出差异表达基因。然后登陆STRING在线数据库对差异基因进行蛋白互作网络分析,得出目标基因在甲状腺乳头状癌和相应癌旁组织中的表达情况;进一步通过免疫组化方法在40例甲状腺乳头状癌标本中验证目标基因的表达水平。结果:1、在3例标本中用基因芯片共筛选出364个差异基因,其中包括282个表达下调的差异基因和82个表达上调的差异基因,其中上调最明显的基因为FN(Fold-change=94.12);共筛选出228个差异LncRNAs,其中207个LncRNAs下调,21个LncRNAs上调。2、筛选出ATP6V1A、ATP6V1F、BCL2、BID、CFH、CFI、FN、ITGA8、ITGAV、ITGB1、KCNJ2、KCNQ1、SMAD9、SPARC、TGFBR1等15个关键基因,以FN为中心,与ITGA8、ITGAV、ITGB1、SMAD9具有重要相关关系。3、FN基因与甲状腺乳头状癌发生的ECM-受体相互作用、焦点粘连、蛋白多糖在癌症中的作用、小细胞肺癌通路相关,与细胞外基质组织、细胞黏着、细胞外小体、蛋白质细胞外基质、细胞外基质、细胞外间隙、蛋白酶结合、肝素结合等功能相关。4、FN在甲状腺乳头状癌癌组织中的阳性率为85%,在相应癌旁组织中的阳性率为42.5%,差异具有统计学意义(P<0.05)。5、FN在甲状腺乳头状癌癌组织中的表达水平高于相应癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:1、FN基因在甲状腺乳头状癌组织中的表达较相应癌旁组织明显上调;2、FN基因可能与甲状腺乳头状癌的发生相关。