DNA序列分布比率法在无创产前胎儿染色体非整倍体检测中的应用

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在临床应用中,母体中的胎儿游离DNA(cell-free fetal DNA,cff DNA)为多胞胎染色体非整倍检测(noninvasive prenatal testing,NIPT)提供了机会;随着辅助生殖技术的发展,双胎和高阶多胎妊娠变得越来越普遍。然而,NIPT在多胎妊娠中的应用是有限的,与单胎妊娠相比,双胎妊娠21-三体(T21)、18-三体(T18)和13-三体(T13)的敏感性分别降低了9%、28%和22%。NIPT的准确性受胎儿游离DNA浓度的影响,敏感筛查至少需要4%,相对低胎儿游离DNA浓度可能会造成检测的假阴性或更高比例的检测失败率。因此,准确估算胎儿的游离DNA浓度是非常重要的,是确保NIPT结果准确性的关键因素之一。近年来,利用母体血浆和胎儿DNA呈现不同的片段模式,提出了一种基于无血浆中胎儿游离DNA与母体游离DNA片段大小不一样的方法,直接从血浆测序数据中确定胎儿游离DNA浓度。本研究共招募362名孕妇,其中单胎203例,双胎69例,多胞胎90例。以怀有男胎单胎孕妇为研究对象,尝试基于DNA序列分布比率(Size Ratio-Based)的方法、Y染色体的方法和常染色体的方法估算胎儿游离DNA浓度,并建立相应的模型。该模型应用于单胎、双胎及多胎妊娠的胎儿游离DNA浓度估算,并将三种方法进行比较,预测胎儿性别和检测胎儿染色体非整倍体。本研究建立起了基于DNA序列分布比率法,并能很好估算双胞胎及三胞胎胎儿游离DNA浓度;研究结果证实双胞胎和多胞胎胎儿游离DNA浓度和孕妇的孕周有正相关性;双胞胎胎儿性别预测准确率在98.6%;多胞胎胎儿胎儿性别预测准确率在97.6%;胎儿染色体非整倍体在7例样本中检出,7例样本中有2例单胎、1例双胎,这三例都通过染色体核型验证。最终证实双胎及多胞胎胎儿性别及染色体非整倍体可以通过NIPT的方法检测。
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