猪繁殖障碍病病原5重PCR及7重GeXP-PCR检测方法的建立

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为了在一个体系中检测多种猪繁殖障碍病的病原,本文设计了两种检测方法,包括猪瘟病毒(classical swine fever virus,CSFV)、非洲猪瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)、高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(highly pathogenic porcine reproductive and respiratory syndrome virus,HP-PRRSV)、猪伪狂犬病毒(pseudorabies,PRV)5重PCR检测方法的建立和猪伪狂犬病毒、猪瘟病毒、非洲猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪细小病毒(porcine parvovirus,PPV)、猪圆环病毒2型(porcine circovirus type 2,PCV-2)、猪流行性日本乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)7重GeXP-PCR检测方法的建立。这两种方法各有优劣,优势互补,可根据实际情况选择应用,提高检测效率。首先,为建立一种能同时检测5种引起猪繁殖障碍的病毒的多重PCR(mPCR)方法,分别针对各病毒的保守序列设计了 4对特异性引物,其中3对分别用于扩增CSFV E2、ASFV VP72、PRV gB基因的目的片段;针对NSP2基因设计的1对引物用于区分PRRSV和HP-PRRSV。通过对反应条件的优化,建立了快速检测CSFV、ASFV、PRRSV、HP-PRRSV、PRV 5重PCR诊断方法。其敏感性结果显示,该mPCR对这5种疾病的最低核酸检测量分别为1.09×104(CSFV),1.50× 103(ASFV),2.10×103(HP-PRRSV),1.30× 103(PRRSV)和 8.97× 102(PRV)拷贝/μL。对49 份临床样品的检测结果显示其混合感染率为51%(25/49)。该方法对阴性样本的扩增结果均为阴性,并且无交叉反应性,表明该方法特异性良好,具有快速、灵敏且成本低等优点,能够对猪繁殖障碍病毒病的单个或混合感染的临床样品进行快速鉴别诊断,并对其流行病学调查具有深远意义。其次,为建立一种基于多基因表达分析平台(GenomeLab Gene Expression Profiler,GeXP),能在一个体系中同时检测 PRV、CSFV、ASFV、PRRSV、PPV、PCV2、JEV 7种猪繁殖障碍病病原的GeXP-PCR检测方法,分别针对各病毒的保守序列设计了 7对特异性嵌合引物和1对通用引物。由这7对特异性嵌合引物启发PCR的扩增,然后由体系中占主导地位的通用引物引发后续扩增,最后再将PCR产物进行GeXP毛细管电泳分析。当用各病毒的阳性样本检测该方法的特异性时,在GeXP的分析系统上都出现了特异性的峰值,且阴性样本的检测结果均为阴性。10倍梯度稀释包含了各病毒序列的质粒,用其检测该方法的灵敏度,其结果显示,在最优的反应条件下,该方法对单种病毒的最低检测限度为100-1000 copies/μL,而当7种病毒同时存在时其最低的检测限度为1000 copies/μL。此外,该方法对64份临床样本的检测结果与常规PCR检测结果完全一致,可见该方法是一种特异性良好的能够对猪繁殖障碍病毒病的单个或混合感染的临床样品进行快速鉴别诊断的检测方法。
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