随着国家对构建多层次资本市场的重视,新三板火爆逐渐超过预期。2013年扩容后挂牌企业规模迅速扩张至目前的7500多家,2016年新三板正式进入分层管理时代。对于新三板挂牌企业来说新三板的飞速发展意味着机遇与挑战并存。能否在新三板市场顺利融资,并高效利用融入资金实现企业的健康成长成为企业急需解决的问题。新三板市场构建时间较短,仍处于探索期,各方面机制与政策性服务并不完善,企业的股权融资环境目前来看还有欠缺,企业对融入资金的配置能力也参差不齐。因此研究企业的股权融资效率,本文指利用融入资金创造价值的效率,并找到提升方法尤为重要。21世纪以来,传统的工业经济已然转向当下的知识经济。伴随着国家科技创新驱动发展战略的出台,创新能力已成为企业的核心竞争力量。新三板挂牌企业多数为科技含量高的初创期民营企业,创新能力直接影响企业的产出,影响资金的配置进而对这种资金的配置效率即股权融资效率产生影响。基于此,本文在对新三板企业股权融资效率测算后将其影响因素划分为企业创新能力的三大方面,并寻找各方面的因素对股权融资效率的影响程度,希望为新三板企业提升股权融资效率做出理论支持。研究结果表明:第一,通过新三板现状分析发现新三板市场融资环境和企业融资能力以及创新能力方面存在问题。第二,通过静态DEA-CCR模型、DEA-BCC模型和超效率DEA模型实证测算可知新三板企业的融资效率普遍低下。纯技术效率有效的企业比规模效率有效的企业多;多数企业于规模报酬递增阶段;DEA有效企业中信息技术业普遍较高。第三,通过动态DEA-Malmaqusit模型发现新三板企业融资效率变动主要来自于技术进步变动。第四,以新三板企业创新能力指标作为技术进步的替换变量,对超效率DEA模型测算的股权融资效率影响因素的回归分析发现:技术创新能力中的研发经费占比对新三板企业融资效率有正向促进作用,但在和技术人员相互作用下,研发经费的促进作用较微弱。技术人员占比对新三板企业的融资效率无显著相关关系;市场管理创新能力和财务创新能力对新三板企业融资效率有正向促进作用;制度方面,以第一大股东持股比例为代表的股权集中度对新三板企业的融资效率无显著性影响,而以前十大股东持股比例为替换变量回归分析发现,其他变量参数无明显改变的情况下,前十大股东持股比例对融资效率有正向促进作用;研究还发现控制变量债务融资方式对企业的融资效率有抑制作用。第五,针对新三板企业股权融资效率优化策略可以从两方面出发:内部着重提升企业创新能力以及改善自身融资方式,外部政府和金融机构重点放在帮助企业提升创新能力以及改善新三板企业融资环境等方面。