【摘 要】
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该文采用Gaussian 98程序,在HF/6-31G-水平上对Adenine(HO)、Thymine(HO)、Cytosine(HO)、Guanine(HO)和Adenine(HO)氢键复合物的可能构型进行优化.然后,在B3LYP/6-31++G(d,p
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该文采用Gaussian 98程序,在HF/6-31G-<*>水平上对Adenine(H<,2>O)、Thymine(H<,2>O)、Cytosine(H<,2>O)、Guanine(H<,2>O)和Adenine(H<,2>O)<,2>氢键复合物的可能构型进行优化.然后,在B3LYP/6-31++G(d,p)水平上对稳定构型进行单点能量计算.例如,Adenine(H<,2>O)的四个可能极小构型A(H<,2>O)-N<,7>H<,2>、A(H<,2>O)-N<,7>、A(H<,2>O)-N<,3>H<,4>andA(H<,2>O)-N<,1>H<,1>在势能面上被找到.其中,A(H<,2>O)-N<,3>H<,4>是四个可能构型中最稳定的,它是一种具有环状平面结构的氢键复合物体系,并表现出一些非传统的结构特征.这里,水既是电子给予体又是质子给予体.分子间结合能的数据表明,四种可能构型A(H<,2>O)-N<,3>H<,4>、A(H<,2>O)-N<,7>H<,2>、A(H<,2>O)-N<,1>H<,1>、A(H<,2>O)-N<,7>的结合能的数值依次增大.A(H<,2>O)-N<,3>H<,4>的结合能为-10.313kcal/mol.最后,通过HF/6-31G<*>计算求得被水化的碱基对Adenine-Thymine(H2O)势能面上可能优化构型,经B3LYP/6-31++G(d,p)考虑电子相关求得这些构型下的分子间结合能.结果表明,在七种优化构型中A--T-w-N<,3>H<,4>最稳定,其分子间总的结合能为-21.003kcal/mol.
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