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虎纹蛙（Hoplobatrachus rugulosus）是广泛分布于我国南方地区的大型无尾两栖类。由于生境片段化和丧失以及人为过度的捕猎,其种群分布范围和数量都急剧的缩小,目前已被列为国家二级保护珍稀濒危动物,IUCN和中国物种红色名录均将其列为易危种,并被载入CITES附录Ⅱ。浙江省是虎纹蛙的重要分布区,然而近年来的种群数量也在极速的下降。本文从基本的珍稀濒危两栖类的非伤害性取样入手,分别通过用近缘物种来跨种扩增和磁珠富集法来筛选虎纹蛙具有多态性的微卫星位点,并对浙江地区的虎纹蛙遗传多样性和遗传结构进行研究,从而以期为该物种在浙江省的保护提供重要的理论依据。本文的主要研究结果如下:1.通过非伤害性对虎纹蛙的血液和趾取样获得的DNA与通过处死后对虎纹蛙肌肉取样获得的DNA进行分子遗传学的检测并相互比较,结果显示三种取样方法所获得的DNA质量相当。因而,在无尾两栖类的研究中,采用非伤害性的取样策略完全能够替代伤害性的取样策略。2.通过引用30对近缘物种的外源微卫星位点在虎纹蛙进行跨种扩增研究,结果显示仅有33.3%的位点在虎纹蛙能够获得扩增结果,有46.7%的位点完全没有产生任何扩增产物。认为在进行跨种扩增时,所引用的物种与所需研究物种的亲缘关系远近和所研究物种的基因组长度将会对跨种扩增结果起到极大的影响。3.利用磁珠富集法从虎纹蛙CA富集的文库中成功筛选出9对具有多态性的微卫星位点。这9个微卫星位点的等位基因数目在6到11个之间（平均8.56）,观察杂合度和期望杂合度分别在0.571到0.935之间（平均0.796）和在0.765到0.888之间（平均0.837）。同时由于Hrug07位点存在无效等位基因,因而该引物表现出明显的偏离哈温平衡（P＜0.01）。在Hrug05和Hrug09两个位点之间则存在着明显的连锁。4.利用磁珠富集法所获得的9对微卫星位点对分布于浙江的7个虎纹蛙种群（n=87）进行遗传多样性检测。结果显示,各位点的等位基因数均大于5个（5-13）,平均每个位点有7个等位基因。各种群的期望杂合度均达到了较高遗传多样性的范畴（＞0.5）。5.通过对各种群瓶颈效应的检测,结果显示:仅有丽水种群在近期没有经历种群瓶颈效应,而其它各种群则在IAM、TPM或SMM三种突变模型下检测到在近期曾经历了种群瓶颈。6.对各种群之间的遗传分化进行检测,结果显示在总共21对样本中,有13对（61.9%）出现了明显的遗传分化（P＜0.001）。根据Nei’s无偏差遗传距离构建的UPGMA聚类图和NJ树显示,该7个种群可分化为分别以长山和汤溪种群为中心,包括昌化种群和以临安和永康为中心,包括丽水和青田种群的2个单系。7.对各种群之间的基因流研究结果显示:Nm值均大于1,各地理种群间存在着一定的基因流。同时在各地理种群中Fis值中的正值较多,则说明在各种群中个体间存在着近交。因而,种群间的基因流程度有限,存在着遗传分化的可能。