全国中小企业股份转让系统(又称新三板市场)在经历了十余年的建设与发展之后,已经成为了我国多层级资本市场建设中不可或缺的重要组成元素。新三板市场的成立与发展,对于解决我国中小微企业,尤其是高新型企业的融资困难问题有着举足轻重的影响,对我国产业转型也有着积极的影响作用。在经历数次深度改革和市场扩容后,新三板市场已经初具规模。但是,不能掩盖自新三板市场成立以来就有的流动性不足的问题。为了提升市场流动性,提高市场效率,全国中小企业股份转让系统将做市商制度引入到市场交易中。市场流动性是与其交易制度密不可分的。从这一角度出发本文对做市商制度与新三板股票流动性以及对流动性波动特征的影响进行了分析。首先本文运用文献梳理法对国内外有关做市商制度、资产流动性以及流动性波动特征的文献进行梳理与总结,然后详细的列举了几种主流资本市场流动性的度量方式,并运用基于神经网络的非线性主成分分析法提取我国新三板市场综合流动性度量指标,并利用该指标,采用非参数检验的方法验证做市商制度的实施与新三板企业股票流动性的关系。随后,再利用基于马尔科夫链的区域转换GARCH模型对该指标进行波动率分析,检验做市商制度与流动性波动率状态变化之间的耦合性,继而分析做市商制度对新三板市场流动性波动率产生的影响,最后,对全文进行总结,并提出相应的政策建议。