动性球菌(Planococcus sp.)NEAU-ST10-9中新型CDF家族蛋白基因cdffT的克隆及功能分析

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中度嗜盐菌(Moderately halophile)指的是在含有3-15%NaCl的条件下表现出最适生长的一个微生物类群。以往报道表明,很多中度嗜盐菌在具有高效耐盐能力的同时也具有高效耐碱能力。与一般非嗜盐菌相比,中度嗜盐菌中耐盐碱基因种类更多,其耐盐碱分子遗传机制也更加复杂。动性球菌(Planococcus sp.) NEAU-ST10-9是本实验分离自松嫩平原盐碱地中的一株中度适盐菌,该菌株能够耐受10%的NaCl并能在pH12的碱性条件下生长。本研究借助大肠杆菌(Escherichia coli)Na+/H+逆向转运蛋白缺陷株KNabc(ΔnhaA, ΔnhaB, ΔchaA),采用基因文库筛选法与基因功能互补法相结合的技术,从动性球菌(Planococcus sp.) NEAU-ST10-9中筛选到一个长2712bp的具有Na+/H+逆向转运蛋白功能的DNA片段。序列分析显示,该片段包含3个完整的开放读码框(ORF1-3)以及各自的SD序列和推测的启动子。其中,ORF1长600bp,含有200氨基酸残基,与东海动性球菌(Planococcus donghaensis) MPA1U2中的一个推测蛋白(hypothetical protein)同源性最高(49%),其基因被命名为hyp;ORF2长531bp,含有177氨基酸残基,与嗜碱芽胞杆菌(Bacillus pseudofirmus) OF4中一个推测的TetR家族转录调控蛋白(TetR family transcriptional regulator)同源性最高(49%),其基因被命名为tetR; ORF3长918bp,含有306个氨基酸残基,与还原硒酸盐芽胞杆菌(Bacillus selenitireducens) MLS10中一个推测的阳离子扩散促进子家族转运蛋白(cation diffusion facilitator family transporter)同源性最高(43%),其基因被命名为cdffT。由于后者是在基因组测序的基础上通过同源比对分析推测的,因此,我们将ORF3与所有已鉴定的CDF家族成员进行同源性比对,包括枯草芽胞杆菌(B. subtilis)中的BsCzcD (Accesion.version No. AAB53029.1)、抗重金属富养罗尔斯通菌(Ralastonia metallidurans)中的RmCzcD (Accesion.version No. YP145596.1)、酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)中的ScCOT1(Accesion.version No. AAA74884.1)和ScZRC1(Accesion.version No. NP013970.1)、大肠杆菌(E. coli)中的EcZitB(Accesion.version No. AAC73839.1))和EcFieF(Accesion.version No.NP418350.1),发现ORF3与EcZitB、RmCzcD、ScZRC1、BsCzcD、ScCOT1以及EcFieF的同源性分别为17.2%、15.2%、14.3%、13.0%、12.9%和11.9%(图3-11)。既然ORF3与已鉴定的CDF家族成员的同源性非常低,那么CdffT应该是CDF家族中的一个新型蛋白。耐盐碱实验表明,cdffT基因能够提供大肠杆菌(E.coli)KNabc对0.4MNaCl、10mM LiCl以及碱性pH8.0的抗性,这暗示cdffT基因具有Na+/H+逆向转运蛋白功能。我们测试了cdffT基因对二价金属离子的抗性。结果显示,在0.2-1.0mM ZnCl2或0.2-0.3mM CdCl2存在的条件下,与负对照KNabc/pEASY T3相比,KNabc/pEASY T3-cdffT均表现出了显著或极显著的抗性;而在0.5-1.0mM CoCl2存在的条件下,与负对照KNabc/pEASY T3相比,KNabc/pEASY T3-cdffT表现出一定抗性,但不显著。此外,在1.0mM ZnCl2、0.75mM CoCl2或0.25mM CdCl2存在的条件下,我们进一步测定了KNabc/pEASY T3-cdffT和负对照KNabc/pEASY T3的二价金属离子耐受生长曲线。结果进一步证实CdffT具有显著的Zn2+和Cd2+抗性,但不具有显著的C02+抗性。为了鉴定cdffT基因的功能,我们测试了CdffT的阳离子/氢离子逆向转运蛋白活性。结果显示,KNabc/pEASY T3-cdffT具有Na+(Li+, K+)/H+逆向转运蛋白活性,而负对照KNabc/pEASY T3不具有Na+(Li+, K+)/H+逆向转运蛋白活性,这表明cdffT基因具有Ng/H+逆向转运蛋白功能。此外,与负对照KNabc/pEASY T3相比,KNabc/pEASY T3-cdffT表现出更高的Zn2+(Cd2+)/H+逆向转运蛋白活性,这表明cdffT基因具有Zn2+(Cd2+)/H+逆向转运蛋白功能。需要指出的是,无论是KNabc/pEASY T3-cdffT还是负对照KNabc/pEASY T3,我们均无法检测到Co2+/H+逆向转运蛋白活性。我们进一步分析了pH值对CdffT的阳离子/氢离子逆向转运蛋白活性的影响,结果显示,CdffT在pH6.5-9.5的范围内具有Na+(Li+, K+)/H+逆向转运蛋白活性,而CdffT在pH6.5-8.5的范围内具有Zn2+(Cd2+)/H+逆向转运蛋白活性。Na+(Li+, K+, Zn2+, Cd2+)/H+逆向转运蛋白活性的最适pH值分别为pH9.0、pH8.5、pH9.5、pH8.0和pH8.0,这表明CdffT的阳离子/氢离子逆向转运蛋白活性具有pH依赖性。底物亲和性分析结果显示,CdffT对Na+、Li+、K+、Zn2+和Cd2+的表观Km值分别为1.10、1.30、1-18、1.00和2.19,表明CdffT的底物亲和性为:Zn2+>Na+>K+>Li+>Cd2+。基于以上结果,我们认为CdffT应该是CDF家族的一个新型蛋白,它不仅具有转运二价金属离子的功能,而且还能转运单价阳离子,这个发现在CDF家族蛋白的研究中尚属首例。此外,我们证实CdffT是通过行使Na+(Li+, K+, Zn2+, Cd2+)/H+逆向转运蛋白活性的方式转运对应阳离子的。
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