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香蕉枯萎病是由尖孢镰刀菌古巴专化型(Fusarium oxysporum f.sp.cubense，FOC)感染的毁灭性病害，目前尚无理想的防治方法。为此，本试验筛选出对镰刀菌具有显著拮抗效果的两株芽孢杆菌B1和B2，采用盆栽试验研究其对香蕉枯萎病的病情抑制率，并应用BIOLOG微平板和PCR-DGGE等方法研究B1和B2对土壤微生物生态的改善效果，主要结果如下： (1)在平板培养条件下芽孢杆菌B1和B2对镰刀菌的抑菌率分别为53.4％和54.3%，其中B2使镰刀菌菌丝出现纠结、扭曲变形现象。在液体培养中B1和B2对镰刀菌孢子萌发抑制率分别达到99.4%、99.8%。 (2)接种B1和B2菌剂30天时，两菌株对香蕉枯萎病的病情抑制率分别为39.9%和42.3%，并且能显著促进感病土壤中香蕉植株生长，其中添加B1处理植株鲜重、干重分别增加了87%和66%；添加B2的处理植株鲜重、干重分别增加了110%和101%。 (3)接种30天时，B1和B2处理的感病土壤微生物生物量碳、氮含量、细菌和放线菌数量显著提高，其中细菌数量分别增加了130%、311%，放线菌数量分别增加了230%、274%，土壤微生物AWCD值、Shannon多样性指数和richness丰富度也显著提高，其中对氨基酸类、糖类和羧酸类碳源的利用程度显著增加。16S rDNA-DGGE分析表明，B1和B2改善土壤微生物群落组成，B1和B2处理土壤细菌多样性、丰富度和均匀度都明显高于感病土壤和CK壤的相应值；各处理不同时间采集的土壤细菌群落结构存在明显差异。而18S rDNA-DGGE分析表明，B1和B2处理不同时间采集的土壤真菌多样性指数、丰富度、均匀度指数基本保持稳定。 接种镰刀病菌后，土壤微生物生态结构遭到破坏、微生物代谢活性降低。接种芽孢杆菌能够显著提高病土细菌、放线菌数量和微生物群落代谢活性，还改变了16SrDNA细菌群落组成，提高了微生物群落多样性，从而修复感病土壤微生物生态结构和功能，接近于CK壤的相应值，从而有效控制香蕉枯萎病。其中B2菌剂处理土壤比B1效果好。B1和B2兼防病和改良土壤作用，可开发为生防菌剂，具有较好的应用前景。