在高等教育深化发展的新阶段,我国大学面临的挑战也日益严峻,如何提升高校人才培养质量、促进高校人才培养模式创新、完善本科教育体系成为高校治理改革的新命题。在这样的背景下,书院成为我国高校破局探索的新尝试。经过十多年的发展,我国高校书院建设初具成效,书院已成为高校综合育人的重要平台。但书院作为高校内部新生的组织形式,如何健全内部组织体系、适应高校现有组织体系和治理改革,成为书院发展过程中必须解决的问题。因此,本研究对书院组织治理问题加以探讨和分析,并提出优化对策。本研究以组织治理为视角运用多案例研究法,以复旦大学、西安交通大学和华东师范大学内部书院为研究对象,围绕与学院平行管理式书院,对当前我国高校书院组织治理状况进行分析。在研究过程中,以文献综述和概念理论阐述为基础,构建了高校书院组织治理的分析框架。以书院功能定位为指引,以治理主体、组织结构及运行权力为核心,对案例高校书院内部治理状况以及书院和高校层面协同治理、书院和学院层面协同治理状况进行了分析。在分析的过程中,注重顶层设计对书院组织治理的影响,将大学发展规划和大学章程的内容引入书院治理研究,并进一步对案例高校书院组织治理情况进行对比,发现这3所高校的书院组织治理情况存在异同。在书院内部治理方面,书院定位的整体方向、治理主体的构成结构以及学生管理组织的定位存在相同点,但书院的设置方式、书院功能的侧重点、组织机构设立的数量和比例、党政权力的分配状况以及学生自我管理的权力大小有所不同。在书院的外部治理方面,书院工作的统筹主体以及学术权力的配置状况有相似性,但书院的顶层设计、校级书院管理组织的设置状况及书院与学院的协同状况方面存在差异。同时也进一步对我国高校书院组织治理在总体定位、治理框架、治理主体、权责关系、以及评价方式方面的特征进行了总结。在前述工作的基础上,本研究发现当前书院组织治理存在顶层设计欠缺、书院内部主体专业性不足、书院内部权力缺乏监督考核、“双院”协同建设不健全以及书院管理服务相对迟滞的问题。因此,本研究认为书院组织治理应从上述问题的角度进行改革,并给出了具体优化建议。