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微生物担负着全球土壤有机碳降解的主要角色，约90％的土壤有机碳的降解是由微生物完成并参与到全球碳循环过程中。在全球气温变暖的背景下，考察典型生境的木质纤维素碳循环过程，以及其限速步骤纤维素降解中的微生物多样性和群落生态功能，不仅可以丰富纤维素降解微生物的信息，完善可再生纤维素生物质碳循环过程的微生物效应机理，而且为应对全球变暖、发展低碳经济提供理论依据和基础材料。本研究主要以耕地土壤为研究对象，借助分子微生物生态学的研究方法（DGGE，T-RFLP等），并尝试结合环境蛋白质组学、稳定性同位素探针等研究手段，探讨纤维素降解过程中土壤微生物群落多样性和群落演替，同时对若尔盖高原湿地甲烷氧化过程中的功能微生物多样性做相应的分析。主要研究结果如下: (1)纤维素降解过程中，土壤微生物的变化主要发生在土壤细菌和真菌微生物群落上，而放线菌微生物并未表现出明显的变化。进一步深入分析发现土壤细菌和真菌微生物群落随纤维素的降解在时间尺度均呈现相似的演替规律，包含前期、后期等几个主要演替类群。我们从磷脂脂肪酸代谢、基因水平、蛋白质水平等不同的角度得到一致的结论。 (2)对细菌微生物类群而言，纤维素降解后期的变化主要集中在β变形菌和酸杆菌的微生物，而在前期和后期的演替类群中一直存在的放线菌和微浮菌门的微生物没有明显的变化。对真菌微生物而言，Ascomycota在整个演替过程中占据优势地位，它们是土壤中纤维素秸秆降解主要的真菌驱动者。 (3)利用微生物合成制备13C标记纤维素，并建立等密度超速离心技术手段，搭建了稳定性同位素探针技术平台，为深入认识木质纤维素碳循环的过程和微生物效应机制打下基础。同时对若尔盖湿地纤维素碳循环中的甲烷营养菌进行初步探讨，发现该生境主要以typeⅠ类型为主，包含4个主要的类群，其中类群Ⅰ为若尔盖高原湿地代表性的类群。