木薯SR蛋白家族的系统命名及表达分析

来源 :海南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:linsc
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
选择性剪接是真核生物基因表达的一种重要调控机制。同一个前体mRNA(pre-mRNA)经过选择性剪接可以形成多种不同的成熟mRNA,从而翻译出很多具有不同结构和功能的蛋白,也是产生蛋白多样性的主要方式。真核生物的剪接因子是选择性剪接的参与者和直接调控元件。作为最重要的两类基本剪接因子之一,SR蛋白家族,具有一个富含丝氨酸/精氨酸(S/R)重复序列的RS结构域,在RNA剪接体的组装和选择性剪接的调控过程中具有重要的作用。近年来,关于植物中SR蛋白家族的研究已取得长足进展,但多限于拟南芥和水稻等模式植物中,而对木薯这一重要经济作物的相关研究未见报道。本研究以木薯为研究材料,基于已完成测序的木薯基因组数据库,利用Blast等程序鉴定到18个可编码木薯SR蛋白的基因,通过MEGA程序构建了系统发生树且进行了系统命名,并对木薯SR蛋白的部分生物学功能进行了初探,具体研究结果如下:首先,通过氨基酸序列多重比对,按照植物SR蛋白的结构特性和同源性,将所鉴定到的18个木薯SR蛋白归入SR蛋白的六大亚家族,并进行了蛋白理化性质分析。结果表明,由于富含带正电荷的Arg残基,SR蛋白均为亲水的碱性蛋白。对基因结构的分析可知,同一亚家族的成员在外显子/内含子数目上具有一定的保守性,而外显子和内含子长度不同。对基因启动子区包含的顺式作用元件的分析预测表明,其特异性元件主要包括光应答元件、各种激素应答元件、胁迫应答元件等,初步映证了木薯SR蛋白与逆境胁迫关系密切。其次,提取了木薯不同组织和胁迫处理下的RNA样本,通过RT-PCR和qRT-PCR对其剪接方式和表达模式进行分析,发现18个木薯SR基因中有14个(78%)表现出组织特异性的选择性剪接。此外,逆境胁迫处理增加了基因的不同剪接方式,且部分SR蛋白的基因表达和剪接模式受到一种或多种胁迫的影响,这与拟南芥中的相关结果相一致。另外,ABA处理后大部分木薯SR蛋白都出现不同的剪接模式,而拟南芥中只有三个基因出现剪接差异。最后,为进一步研究木薯SR蛋白的生物学功能,以木薯不同组织部位和不同逆境处理的RNA为材料,利用Gateway BP克隆酶将18个木薯SR蛋白转入到pDONR207入门载体中,并通过Gateway LR克隆酶转入到含有在N或C末端的GFP蛋白标签的载体中。通过烟草瞬时表达系统表达GFP融合蛋白,研究发现木薯18蛋白都具有位于细胞核中的荧光信号,表明木薯SR蛋白是核定位蛋白,这与SR蛋白作为重要剪接因子参与和调控转录后剪接的生理功能相一致。
其他文献
选用3种分子量的PES作为制膜材料,聚乙烯吡咯烷酮(PVPK30)作为添加剂,N-甲基吡咯烷酮作为溶剂,聚酯无纺布作为支撑材料,利用非溶剂致相分离法制备超滤膜.通过超滤实验和爆破强度的测
本文依据研究区二维地震、测井和野外露头资料开展西部冲断带构造特征及演化,探讨它们对油气藏形成的控制,预测有利勘探区。本文首先开展地震地层反射标志和地质层位的识别研究。在判别地震极性基础上,以山西-太原组煤层、侏罗系煤层的强振幅反射标志层为依据完成了地震剖面的标定,同时识别出了中下三叠统砂泥岩弱反射、蓟县系白云岩弱反射等特征。其次,在地震剖面识别出研究区发育重要的地层不整合面:元古界断陷层顶界不整合
南京市琅琊路小学分校科睿小学创建于2014年,学校在尊重、学习、传承南京市琅琊路小学办学理念的基础上,以江苏省教育科学“十三五”规划课题“支持小学生深度学习的‘学程盒
本研究致力于筛选出小豆苗期抗旱性的生理指标并据此鉴定品种抗旱性。以白红3号、白红4号、白红6号、冀红352等小豆品种为材料,对各品种苗期进行不同浓度(5%、10%、20%)PEG模
数学课程改革是素质教育深入发展的要求。培养学生正确的数学观,创造有利于学生主动学习数学的环境.充分运用现代化的教学设备等是我国数学教育改革的新方向。
9月11日,第四届北京全球友好机场总裁论坛在北京闭幕。面对19个国家和地区20多家机场,论坛主办单位的首都机场股份有限公司总经理史博利在接受记者专访时谈起的是“第一国门”
报纸
目前,环境保护工作备受重视,社会各行业都将环境保护列入工作重点,坚持贯彻环保理念,落实环保政策,以实现经济与环境的协调发展。电厂化学水处理作为环保工作的重要环节,同样
为了研究级间参数对对转桨扇气动性能的影响。首先,在UTC的SR-3桨扇构型的基础上,生成了一种八叶桨扇模型,并对该桨扇进行了性能验证。然后,采用该单桨扇的正反桨生成了对转
自十八届六中全会召开以来,党中央认真贯彻落实创新、协调、绿色、开放、共享的发展理念,坚持发挥市场在资源配置中的决定性作用和优化政府职能,建立健全全民所有自然资源资
中国的房地产市场自2003年升温以来,经过了几年的持续快速的增长,在经历短暂的调整之后,中国的房地产市场又迎来了一个“报复式飞涨”的大牛市,2009年可以说是中国楼市快速发展、