本研究旨在通过层次分析法在上海某综合性医院临床科室综合绩效评价中的实际应用以及与其它方法的比较，尝试建立临床科室综合绩效评价的指标体系，分析影响综合绩效的因素，提出提高临床科室工作绩效的建议和对策。本研究通过现场调查获得了2003年某医院22个临床科室医疗、科研、资源配置以及经济现状；应用文献评阅法、专家咨询法和层次分析法建立了临床科室综合绩效评价指标的阶梯层次结构并确定了各指标的权重系数；在应用平均极值法对原始指标值进行归一化处理的基础上，用层次分析法计算出临床科室的综合绩效指数。本研究还将层次分析法与另外两种综合评价方法(加权秩和比法和Topsis法)对相同临床科室综合绩效评价的结果进行了比较分析。 　　通过研究表明，层次分析法作为一种定性与定量分析相结合的多因素决策技术，可以用于评价医院临床科室综合绩效。与加权秩和比法和Topsis法相比，不仅评价结果具有一致性，而且层次分析法既能科学判断指标权重的大小，又能充分运用原始数据差异，因此具有综合性、灵活性和简洁性等优点，可以成为医院管理者提高科学管理水平的有效工具。