基于多组学的全氟辛酸与全氟辛烷磺酸致毒通路研究

来源 :南京大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:listsetmap
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
全氟和多氟烷基类化合物(Perfluoroalkyl and Polyfluoroalkyl Substances,PFASs)是一类高生物蓄积性,多毒性终点的新型持久性有机污染物(Persistent Organic Pollutants,POPs)。全氟辛酸(Perfluorooctanoic acid,PFOA)与全氟辛烷磺酸(Perfluorooctane sulfonate,PFOS)是两种全球生产量与使用量最大PFASs,广泛存在于水体,大气,土壤及沉积物中,可被人体通过多途径摄入。已有的报道显示,PFOA与PFOS被生物摄入后,可以引发多器官毒性,致癌等多种类型的毒性。高通量筛选技术(High-throughput screening,HTS)替代传统毒性测试,让对包括PFASs在内的化学物质的毒性研究重点从“描述性”的动物试验转向以“预测性”毒性通路为重点的靶向高通量体外测试。现有的关于PFOA与PFOS毒性的研究存在以下问题:(1)如何将HTS提供的大量分子机制数据外推到个体水平;(2)只检测个别典型的生物事件,缺乏对PFOA与PFOS的全面生物效应研究;(3)仅对PFOA与PFOS少量的剂量-效应或高剂量毒性研究,缺乏低浓度全剂量-效应研究。组学技术可一次性测试PFASs扰动下的多个分子生物效应,而有害结局路径(Adverse outcome pathway,AOP)可将这些分子水平的启动事件(Molecular initiating events,MIEs)与个体水平有害结局(Adverse outcomes,AOs)建立关联。本研究通过(1)基于AOP,联合Tox Cast体外测试数据,构建化学物质的毒性预测方法,结合Pub Chem数据库对该方法进行评估,并使用该方法对PFOA与PFOS的致毒通路进行预测。(2)使用剂量-效应人类简化转录组(Reduced human transcriptome,RHT),对PFOA与PFOS在通路水平的生物效应进行识别并对其致毒通路进行预测。(3)通过CRISPR-Cas9功能基因组筛选技术获取PFOA与PFOS引发细胞脂质积聚的关键分子机制。主要的研究内容与结果如下:(1)建立了联合AOP与Tox Cast体外测试数据的化学物质毒性预测方法,并使用该方法对PFOA与PFOS进行潜在致毒通路的预测。首先使用101个化学物质建立并验证毒性预测方法,结果显示,101种化学物质共可潜在引发58个AOs,共覆盖11个毒性类型。其中,致癌/遗传毒性,生殖毒性与消化系统毒性的真阳性预测率(True positive rate,TPR)均超过了70%,而神经毒性与呼吸系统毒性的TPR均低于30%。不同毒性类型的TPR与AOP知识库中该毒性类型的AOPs,MIEs,体外测试的数量,及化学物质体外测试数量呈显著正相关(p<0.02)。PFOA可潜在诱导9个MIEs,共引发9个AOs(共参与12条AOPs),覆盖5种毒性类型,TPR为36.36%。PFOS可潜在诱导37个MIEs,可引发40个AOs(共参与61条AOPs),共覆盖11个类型的毒性,TPR为100%。此次预测结果还显示PPARα是PFASs引发肝脏毒性,消化系统癌症及雄性生殖毒性的潜在关键因子。上述结果表明,联合体外生物测试,AOP框架有潜力实现批量化学物质的毒性预测,对PFOS毒性预测准确性强于PFOA,PFOS比PFOA更有潜力通过多种致毒通路引发多种类型的毒性。(2)使用剂量效应的RHT技术对PFOA与PFOS的通路水平的全生物效应进行识别,可弥补因Tox Cast数据库内覆盖的生物靶点有限而无法完全预测PFOA与PFOS致毒通路的不足。结果表明,PFOS引发Hep G2细胞毒性,干扰生物学通路及基因本体(Gene ontology,GO)的效力均高于PFOA,毒性起始点(Point of departure,POD)值相差超过0.5个数量级(μM)。RHT识别到PFOA与PFOS分别响应104与114个生物事件(Key events,KEs),在数量及毒性类型覆盖上优于体外测试数据预测结果。PFOA与PFOS诱导的低暴露剂量KEs与血管发育,脂肪酸代谢,细胞增殖有关,可能会引发心血管发育异常,肥胖与肿瘤等有害结局。以上结果表明,相比于体外测试数据直接预测PFASs可诱导的MIEs,基于RHT能识别到两种PFASs有响应的普通KEs与AOs,可以为毒性通路的预测提供更多生物水平的证据。(3)CRISPR-Cas9功能基因组可挖掘PFOA与PFOS关键致毒通路的新分子机制。RHT可全面识别两种PFASs的通路水平生物效应,但却无法获得更多的新分子机制信息。使用CRISPR-Cas9功能基因组筛选结果显示,PFOA与PFOS共同富集到的抗性基因主要与癌症,信号传导,炎症,类固醇合成及钙信号传导过程有关。而PFOA特异性显著(p<0.05)富集的抗性基因主要与癌症,免疫,脂质代谢,心血管疾病相关,PFOS特异性显著(p<0.05)富集的抗性基因主要与信号传导,甲状腺素合成,神经发育,脂质代谢及心肌收缩异常有关。此次筛选识别到两种PFASs引发细胞脂质积聚的新机制,即通过诱导NUDT7基因表达的下调,促进Hep G2细胞的甘油三酯及胆固醇的含量上升。上述结果表明,CRISPR-Cas9功能基因组可以识别PFASs的关键致毒的新分子机制,联合AOP可对该新分子机制所依赖的致毒通路进行预测。基于Tox Cast体外测试数据,可以通过识别两种PFASs潜在有活性的MIEs预测致毒通路,但由于Tox Cast体外测试覆盖生物靶点有限,而无法对致毒通路进行全面预测。RHT技术可以全面识别PFASs的通路水平生物效应,通过识别有响应的KEs或AOs,为PFASs的致毒通路提供更高生物水平的证据与剂量效应关系。CRISPR-Cas9功能基因筛选技术可以挖掘两种PFASs的关键致毒通路新分子机制,结合AOP可预测该新分子机制依赖的致毒通路。综上,联合多组学技术与AOP,可以全面识别与表征PFOA与PFOS的致毒通路,为将来更多PFASs致毒通路的预测研究提供新方法。
其他文献
近年来,经济快速发展和人口迅猛增长等问题导致水资源严重短缺,中水回用成为解决日益增长的水资源需求和水资源日益短缺矛盾的主要手段。中水中含有大量病原微生物,直接回用或者排放到受纳水体中都会引起水生疾病的传播。因此,消毒已经成为污水处理工艺中一个必要环节。然而,消毒剂能与中水中含有的大量溶解性有机物和无机离子如溴离子、碘离子和铵根离子等发生反应,生成消毒副产物(Disinfection byprodu
学位
本工作用聚合物氮化碳(PCN)和共价三嗪骨架材料(CTFs)等新型碳氮材料作为负载型Pd金属催化剂载体,用多种物理化学手段结合微型催化反应评价研究了Pd金属在这类新型碳氮材料载体表面的分散状态、Pd金属与碳氮载体间的相互作用及它们对Pd金属催化剂乙炔选择性加氢性能的影响。研究结果表明以新型碳氮材料CTFs和PCN为载体的负载型Pd金属催化剂具有较优异的催化性能,不同载体的Pd金属催化剂它们之间活性
学位
水系氧化还原液流电池(ARFB)被认为是大规模储能最有希望的候选者之一。目前大规模的全钒氧化还原液流电池(VRFB)因其高功率密度和长循环寿命而被成功地商业化。然而,钒基电解液和离子交换膜的高成本阻碍了该技术的广泛应用。近年来,为了实现低成本和可持续的能源存储,研究人员开始将注意力转向水系有机氧化还原液流电池。想要获得理想的电池性能,通常需要设计具有较高溶解度和稳定性的廉价有机活性分子。针对这些问
学位
重金属污染是我国湖泊存在的重要环境问题之一,目前常规的监测和分析方法较为复杂且耗时,因而采用经济、高效的方法诊断重金属污染具有重要意义。本文以太湖沉积柱为研究对象,采用同位素210Pb与137Cs对沉积柱分层样品进行定年,分析13种重金属(Cr、Cd、Pb、Cu、Zn、Ni、Co、Ti、Fe、Mn、As、Hg、Sb)的总量及形态,测试磁学参数及沉积柱理化指标。首先从垂直方向上把握沉积柱在不同年代重
学位
原子力显微镜凭借高的空间分辨率和高灵敏度是目前在生理条件下研究生物样品的重要工具之一。除了作为经典的微纳米级成像工具,原子力显微镜也可被采用为一种单分子力谱技术,广泛的应用到生物样品的力学操作研究中。通过原子力显微镜针尖对单个分子的吸附和拉伸,研究分子本身的力学性质和分子与分子之间的作用力。单分子力谱具有生物相容性好、检测力范围广等优点,可以检测到皮牛(pico Newton,p N)级别的力变化
学位
<正>被誉为“世界消化内镜治疗学奠基人”和“世界内镜外科之父”的蓝庆民(Nib Soehendra)教授,是对世界消化内镜技术的开创性发展做出巨大贡献的第一位华人!1968年蓝庆民教授从德国汉堡大学医学院毕业后,便开始了内镜外科医师生涯,直至2008年退休时,他先后发明和开拓了内镜外科的二十多项核心基础技术,如内镜下胆道内引流术、黏膜病灶切除术(ESM)、Soehendra毕Ⅱ式乳头肌切开刀、So
期刊
近红外2μm波段由于其在军事、医疗、科研、通信以及工业生产等各个方面具有重要应用,一直是现在的科研研究热点。同时光纤激光器相比于传统的固体激光器,半导体激光器又具有结构紧凑,成本低廉,光束质量好等特点,因此我们围绕2μm的光纤激光器做了许多的研究。本课题研究的主要内容是基于2μm近红外光纤激光器.首先介绍了光纤中的损耗,色散和非线性这几种现象,然后介绍了光纤激光器的基本原理,和常见的器件,接下来介
学位
微塑料污染在水环境中广泛存在,通过经口暴露对水生生物肠道造成了潜在健康风险。已有研究表明,粒径是微塑料肠道毒性的重要影响因素,但粒径效应的作用机制尚不清晰。在现有的微塑料肠道毒性研究中,毒性检测技术较为单一并多以表型研究为主,缺少从细胞水平对微塑料毒性作用的系统研究。肠道细胞功能通常与肠道菌群紧密相关,因此可以通过肠道微生物变化探究微塑料肠道毒性的作用机制。基于以上背景,本研究以粒径为100 nm
学位
多功能固态发光材料的应用和理论研究一直是人们关注的热点问题。为实现高性能的固态发光器件,发光基元的设计成为一个重要科学问题。碳硼烷作为一个非典型的结构基元,可以用以制备多功能的发光分子,例如多重发射、聚集和结晶诱导的发射增强、以及发光颜色变化,具有重要价值。但是理性设计碳硼烷衍生物的研究才开始不久,涉及到碳硼烷基发光分子的光物理性质需要做进一步的探索。此外,阐释碳硼烷对材料发光行为的调控机理有助于
学位
新型碳材料的卓越性能推动了众多领域的基础研究和应用发展,具有径向π共轭系统的环对苯撑可以用于构建碳纳米材料,其独特的分子结构带来了新颖多样的化学性质和实际应用。本论文的主要研究方向是基于[10]环对苯撑超分子自组装性质构建富碳薄膜材料。通过[10]环对苯撑与C60衍生物的主客体作用得到二维复合物薄膜,研究了薄膜的溶液自组装行为和机理,探究了薄膜材料在光电方面的相关性质,具体研究工作如下:(1)合成
学位