地中海贫血筛查指标的FTIR/ATR光谱分析方法研究

被引量 : 2次 | 上传用户:JessicaGu45
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
地中海贫血是危害极为严重的单基因遗传病,在我国广西、广东等南方地区具有较高发病率,目前尚无有效的治疗手段,地贫筛查是防止地贫症患儿出现的主要预防手段。血红蛋白浓度(HGB)、平均红细胞血红蛋白含量(MCH)、平均红细胞体积(MCV)是其中主要指标,但现有测定方法需要对不同指标用不同的化学试剂进行化学反应,不利于大人群筛查。本课题采用傅立叶变换红外光谱(FTIR)结合衰减全反射(ATR)技术,建立无需化学试剂、精度适中、直接快速同时测定上述指标的定量分析方法。首先随机抽取部分全血样品分别加入蒸馏水,溶为2倍、3倍、4倍、5倍、6倍的溶血样品,连同全血样品一起共得到6个样品组,分别进行FTIR/ATR光谱实验,探讨利用FTIR/ATR光谱分析HGB、MCH、MCV等指标可行性和样品的光谱测定方法。经分析,确定采用2倍溶血的形式测定样品,然后对其余的全部样品进行FTIR/ATR光谱测定实验。采用光谱数据结合常规测定方法得到的HGB、MCH、MCV的参考值(化学值)分别建立各指标的光谱定标预测模型。基于定标集和预测集的不同划分,分别采用单波数回归、直接偏最小二乘法(PLS)、基于Savitzky-Golay (SG)平滑的PLS、移动窗口PLS(MWPLS)和等间隔组合移动窗口MLR (ECMWMLR)等方法系统深入的进行光谱预处理模式的优选、分析波段(或波数组合)的选择,模型的稳定性分析等,最后对优选的模型进行再次检验。主要结果如下:1)考虑到定标集和预测集的不同划分会造成模型预测效果的波动,为了得到稳定可靠的结果,本文提出了一种新的定标和预测集的划分方法,并构建计算机算法平台将全体样品做50次定标和预测集的划分,计算50次不同划分的模型预测均方根偏差(RMSEP)和预测相关系数(RP)的平均值(RMSEPAve、RP,Ave)等,然后基于RMSEPAve优选稳定可靠的模型;2)把SG平滑模式由原来的117个扩充为540个,将全部540个SG平滑模式与PLS模型结合,构建基于SG平滑的PLS算法平台,可以大范围同时优选SG平滑模式与PLS因子数。HGB、MCH、MCV三个指标的全谱模型结果都表明,其最优SG-PLS模型的预测效果明显优于直接PLS模型的预测效果,并且筛选出的SG平滑模式和PLS因子数是稳定的,从而建立了一种有效的光谱预处理模式筛选方法;3) MWPLS方法是著名的光谱分析波段的优选方法,但是本文发现基于定标集和预测集的不同划分,MWPLS方法的最优波段会变化,为了得到稳定的结果,本文基于50次不同划分分别建立MWPLS模型,按照RMSEPAve优选最优波段,同时得到稳定可靠的模型。这里还编写了起点波数(B)、采用波数点数(N)和PLS因子数(F)都任意可变的MWPLS算法程序平台,并设置合理的参数范围,使得筛选的最优波段达到全局最优。其中,HGB、MCH和MCV的最优MWPLS模型参数(B,N,F)分别为(1178cm-1,12,2)、(1549cm-1,9,6)和(3098cm-1,310,5),它们的(RMSEPAve, RP,Ave)分别为(5.334g/L,0.968)、(1.794pg,0.910)和(4.299fl,0.869),明显优于全谱的最优PLS模型,并且采用的波数点个数很少,大大的降低了模型的复杂性。4)采用本课题组新近提出的ECMWMLR方法分别建立HGB、MCH和MCV的最优等间隔离散模型,构建了起点波数(B)、采用波数点数(N)和采用波数点的间隔(G)都任意可变的ECMWMLR算法平台,并设置合理的参数范围,使得筛选的最优波数组合达到等间隔的全局最优。其中,HGB、MCH和MCV的最优ECMWMLR模型参数(B,N,G)分别为(1952cm-1,4,68)、(3568cm-1,8,69)和(3964cm-1,13,109),它们的(RMSEPAve,RP,Ave)分别为(5.036g/L,0.972)、(1.662pg,0.919)和(3.929fl,0.892)。最优ECMWMLR模型的预测效果比最优MWPLS模型还要好一些,它克服了光谱的共线性,同时还保留MLR的简单性,比MWPLS方法更进一步降低了模型的复杂性。本文率先建立了基于FTIR/ATR光谱的地贫筛查指标HGB、MCH和MCV的同时定量分析方法,并进行了模型优选和稳定性分析,该方法具有精度适中、直接快速的优点。基于MWPLS、ECMWMLR方法得到的最优波段、最优波数组合分别为连续型、离散型的小型专用红外光谱仪器的高信噪比分光系统的设计提供重要依据,也为FTIR/ATR应用于人体血液地贫筛查指标的同时定量分析提供稳定可靠的模型。论文所提出的系统方法也能够应用到其他的光谱分析领域。
其他文献
<正>金秋九月,"清风"送爽。吕梁市农廉办传来好消息:自2009年底全市开展"一企一事一业"活动以来,各县市区企业积极响应政府号召,自觉投资项
我国境内蕴含着丰富的煤焦油资源,而煤焦油的加工方法多为中温焦油、高温焦油,国内对于这两种加工方法的研究也比较多,相比之下,低温煤焦油深加工方面的研究还比较缺乏,本文
城乡一体化是当前学界研究的热点问题之一。城乡一体化既是一个结果,更是一个过程,对这个过程的动力机制进行研究具有重要意义。本文以海南省海口市为实证对象,采取因子分析
【正】 目前理论界的许多人把农业合作化等同于农业集体化。这两个范畴之间到底有无区别?有何区别和联系?搞清这个问题,无论在理论上澄清混乱或糊涂观点,还是在实践上更好地
中国玉文化传统是一种具有内在连接的变体链,伴随着社会文化变迁,在不同历史进程中的传统之间存在着一定的连续性与统一性。具有"克里斯玛"特质的"文化密码"不但是中国玉文化
本文通过回顾与分析信息视觉化相关的动态作品,研究信息设计方法在动画中的视觉效果,探讨发掘图表设计元素在动画中可能的视觉样式,以此拓展信息设计理论与动画设计理论的交
<正>不只是煤制天然气受限,煤制油项目更是三次遭遇政策性规范。先是众星捧月,随之遭遇坚冰,煤制天然气最终也未能逃脱
今天我们来关注一种速生林的命运,那就是桉树。作为世界三大速生树种之一,桉树正成为中国应用最广泛、颇具竞争力的经济发展引擎。广西是桉树种植的第一大省区。十年前,为防
美国金融危机使中小企业严重受挫,在这后金融危机时代,我国中小企业所面临的环境更加复杂,原材料价格持续上涨、劳动力成本上升、融资难且成本高、自主创新能力不足等问题导
马克思主义与中国传统思想文化中的契合点促使中国人接受了马克思主义 ,选择了社会主义道路。契合点为 :马克思主义的革命实践性与中国知识分子对待外来文化思想的实用理性相