156份新疆葡萄种质资源分子标记分析

来源 :新疆农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:judehui01
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葡萄是在世界上被大量种植栽培的果树种类之一。由于栽培种植的时间长,种植量大,从而导致了众多的种群和品种群。使得其种类众多,种内变异也非常普遍,变异也很大,加上种间的自然杂交及世界范围内对葡萄的广泛繁殖,使得对葡萄的品种的分类与鉴定十分困难,难以准确界定其种类。本文在在建立和优化葡萄SRAP分子标记反应体系的基础上,应用SRAP分子标记对156份葡萄种质进行分析,评价供试葡萄种质资源的亲缘关系及遗传多样性水平。主要研究结果如下:1.比较了三种DNA提取方法,SDS法与传统的CTAB法提取的DNA都可以用作SRAP模板,但改良的CTAB法操作相对简单快捷,提取的DNA纯度也比较高。本研究采用改良的CTAB法提取到的高质量DNA,适合进行SRAP分析。2.通过对SRAP体系各个因素的研究,以及通过各因素的对比及分析,建立了葡萄的SRAP反应体系,最佳的SRAP反应体系组分为:总反应体积为25μL,包括1μL模板DNA (50ng),0.5μL上游引物(10μmol·L-1)0.5μL下游引物(10μmol·L-1),0.2μLTaqDNA聚合酶(2.5U·μL-1),0.5μL dNTPs(10mmol·L-1)。3.从100对SRAP引物中筛选出多态性较高、能稳定清晰扩增的10对引物,对156份葡萄种质进行遗传多样性分析,结果显示10对引物共扩增出174条带,其中多态性带173条,多态性带比例为99.43%。采用POPGEN version1.32软件计算出供试葡萄的Shannon指数的范围为0.4434-0.5859, Nei’s基因多样性的范围为0.2863-0.4062。4.利用NTSYSpc2.10t软件对156份葡萄样品SRAP标记的扩增结果进行统计分析,葡萄样品间遗传相似系数变异在0.259-1.000之间,通过非加权组平均(UPGMA)法制作遗传关系树状图,SRAP标记在相似系数为0.522时将所有葡萄材料分别聚为三大类。
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