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微孢子虫(microsporidia)是一类细胞内专性寄生的单细胞真核生物，以对环境具有抗性的自由孢子的形式进行感染和传播，可广泛寄生于几乎所有的动物，包括原生动物和人类。本文主要针对昆虫微孢子虫在感染、入侵寄主过程中起重要作用的孢子表面蛋白开展了蛋白质组学的初步研究。在比较SDS法、碱溶法和沸水浴法等抽提微孢子虫孢子表面蛋白的方法基础上，相继进行了SDS-PAGE电泳、Shotgun质谱鉴定与生物信息学的分析研究，并获得了如下结论：
(1)沸水浴法抽提微孢子虫孢子表面蛋白的效果较为理想。通过比较SDS法、碱溶法和沸水浴法抽提家蚕微孢子虫、柞蚕微孢子虫、桑尺蠖微孢子虫、小菜蛾微孢子虫和斜纹夜蛾微孢子虫等孢子的表面蛋白，认为沸水浴法抽提的表面蛋白的主要蛋白条带的相对蛋白含量较高，且该方法抽提表面蛋白步骤简单、重复性好。
(2)获得了沸水浴法抽提微孢子虫孢子表面蛋白的SDS-PAGE图谱。图谱分析发现家蚕微孢子虫、柞蚕微孢子虫、桑尺蠖微孢子虫、小菜蛾微孢子虫和斜纹夜蛾微孢子虫的表面蛋白均出现了一条介于26.0kDa-33.0kDa之间的共同主带。在28kDa处，除小菜蛾微孢子虫无蛋白条带外，其余四种微孢子虫均有明显条带。在26kDa处，除柞蚕微孢子虫无蛋白条带外，其余四种微孢子虫均有明显条带。
(3)采用Shotgun质谱鉴定了柞蚕微孢子虫和家蚕微孢子虫部分表面蛋白。对SDS-PAGE图谱的相同位置蛋白条带，利用Sequest软件搜索本地蛋白质库鉴定到了5个柞蚕微孢子虫假定的表面蛋白，分别命名为NaHSWP1、NaHSWP2、NaHSWP3、NaHSWP4和NaHSWP5。其中NaHSWP1、NaHSWP3和NaHSWP4与家蚕微孢子虫的表面蛋白SWP30(gi259511816)、HSWP(西157382914)和SWP12(gi257096789)相似性最高，而NaHSWP2与Microsporidium sp.TB-2M-H1的假定表面蛋白HSSP（gi29691978）相似性最高，而NaHSWP5与SLT-1α(gi134536)相似性最高。另外还鉴定到了5个家蚕微孢子虫假定的表面蛋白，分别是SWP30(gi259511816)、HSWP(gi157382914)、SWP32(gi259511817)、SWP25(gi259511814)和与Microsporidium sp.TB-2M-H1的假定表面蛋白HSSP（gi29691978）相似性最高的NbHSWP。
对图谱的不同位置蛋白条带，通过Mascot搜库软件对NCBI非冗余蛋白质数据库进行检索，经过人工筛查高可信度蛋白质结果，获得了2个家蚕微孢子虫假定的表面蛋白SWP30（gi259511816）和HSWP(gi157382916)，而仅获得了1个柞蚕微孢子虫假定的表面蛋白NaHSWP6。其中NaHSWP6与Lysozyme C(gi126608)相似性最高。
(4)柞蚕微孢子虫假定表面蛋白NaHSWP3、NaHSWP4、NaHSWP5和NaHSWP6的生物信息学分析。结果显示，NaHSWP3具有1个潜在的信号肽和跨膜结构域，主要定位于内质网。NaHSWP4具有一个BAR蛋白家族结构域，位于第112-225位氨基酸处。NaHSWP5具有2个核糖体失活蛋白RIP家族特征区段和志贺样毒素亚基A区段。NaHSWP6具有1个溶菌酶C区段，位于第23～147位氨基酸残基处。